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NC | Polysome profiling应用:线粒体甲基化调控线粒体核糖体组装

来源:新使生物时间:2025-06-27 08:39

导读

S-腺苷甲硫氨酸(SAM)是细胞主要的甲基供体,参与表观遗传和大分子合成。约30%的SAM在线粒体中,支持泛醌、硫辛酸生物合成及线粒体RNA和蛋白质的甲基化。

线粒体基因表达依赖线粒体内SAM(mitoSAM),它促进tRNA和rRNA的多种甲基修饰,帮助核糖体组装和功能。相关甲基转移酶包括TRMT10C、METTL15、NSUN4等。

线粒体RNA通过专门核酸酶加工成熟。SAM无法在线粒体内合成,需通过SLC25A26编码的转运蛋白导入。SLC25A26变异会导致严重线粒体疾病,SAM导入不足会损害线粒体基因表达。

2025年6月25日,瑞典斯德哥尔摩Anna Wredenberg团队在Nature Communications上发表了一篇题为“The mitochondrial methylation potential gates mitoribosome assembly”的论文,通过降低小鼠骨骼肌和成纤维细胞中的线粒体甲基化能力,发现mitoSAM对核糖体基因加工非常重要。小亚基可在12S rRNA加工完成前开始组装,而甲基化是大亚基成熟和PTC组装的关键步骤,凸显了SAM在线粒体基因表达中的核心作用。

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文章索引

【标题】The mitochondrial methylation potential gates mitoribosome assembly
【发表期刊】Nature Communications

【发表日期】2025年6月25日
【作者及团队】瑞典斯德哥尔摩Anna Wredenberg团队

【IF】14.7


研究结果

一. 线粒体SAM耗竭导致基因表达逐步受损

SAMC是线粒体SAM唯一进口通道,敲除导致线粒体SAM缺乏。

肌肉特异性敲除小鼠表现出12S rRNA甲基化下降和呼吸链蛋白减少,线粒体mRNA增加但部分mtRNA减少,mt-tRNA稳态水平受影响,表明转录与翻译失衡。

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二. 线粒体甲基化潜能影响原始转录本的加工

作者利用长读长测序,发现线粒体SAM缺乏导致未加工转录本显著增加,尤其集中在线粒体核糖体基因簇和含tRNA的多顺反子区域。

Samc敲除小鼠和细胞中,12S和16S rRNA加工受阻,未加工转录本对转录抑制敏感,表明甲基化对线粒体RNA加工至关重要。

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三. 线粒体核糖体组装依赖线粒体SAM

Polysome profiling多聚核糖体分析显示线粒体SAM缺乏导致线粒体翻译受损,肌肉敲除小鼠轻度下降,细胞完全缺失则无翻译活性。

核糖体组装异常,小亚基积累未成熟蛋白,大亚基减少,早期加工因子异常富集,表明甲基化缺失使核糖体成熟和组装受阻。

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四. mt-tRNAPhe和mt-tRNAVal的加工促进早期核糖体组装

mtF和mtV作为结构性tRNA参与线粒体核糖体组装。mitoSAM缺失时,这些tRNA和未加工rRNA积聚,导致核糖体早期组装受阻。

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五. 大亚基组装依赖线粒体SAM

线粒体SAM缺失导致mtLSU组装停滞,肽酰转移酶中心未成熟,阻碍完整核糖体形成。

关键组装因子和结构性tRNA异常结合,核糖体蛋白uL16m缺失影响结构成熟,最终导致核糖体功能受损。

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六. 线粒体SAM是肽酰转移酶中心成熟所必需

线粒体SAM缺失导致肽酰转移酶中心(PTC)部分无序,阻碍PTC关键环状结构的甲基化和重塑,进而妨碍GTPBP5结合和PTC成熟,最终抑制线粒体大亚基的组装和功能。

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总结

本研究发现S-腺苷甲硫氨酸(SAM)是细胞主要的甲基供体,在线粒体基因表达中关键,揭示了SAM对线粒体rRNA加工和大亚基成熟的重要作用,连接了细胞甲基化能力与线粒体翻译功能。

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