S-腺苷甲硫氨酸(SAM)是细胞主要的甲基供体,参与表观遗传和大分子合成。约30%的SAM在线粒体中,支持泛醌、硫辛酸生物合成及线粒体RNA和蛋白质的甲基化。
线粒体基因表达依赖线粒体内SAM(mitoSAM),它促进tRNA和rRNA的多种甲基修饰,帮助核糖体组装和功能。相关甲基转移酶包括TRMT10C、METTL15、NSUN4等。
线粒体RNA通过专门核酸酶加工成熟。SAM无法在线粒体内合成,需通过SLC25A26编码的转运蛋白导入。SLC25A26变异会导致严重线粒体疾病,SAM导入不足会损害线粒体基因表达。
文章索引
【发表日期】2025年6月25日
【IF】14.7
研究结果
SAMC是线粒体SAM唯一进口通道,敲除导致线粒体SAM缺乏。
肌肉特异性敲除小鼠表现出12S rRNA甲基化下降和呼吸链蛋白减少,线粒体mRNA增加但部分mtRNA减少,mt-tRNA稳态水平受影响,表明转录与翻译失衡。
二. 线粒体甲基化潜能影响原始转录本的加工
作者利用长读长测序,发现线粒体SAM缺乏导致未加工转录本显著增加,尤其集中在线粒体核糖体基因簇和含tRNA的多顺反子区域。
Samc敲除小鼠和细胞中,12S和16S rRNA加工受阻,未加工转录本对转录抑制敏感,表明甲基化对线粒体RNA加工至关重要。
三. 线粒体核糖体组装依赖线粒体SAM
Polysome profiling多聚核糖体分析显示线粒体SAM缺乏导致线粒体翻译受损,肌肉敲除小鼠轻度下降,细胞完全缺失则无翻译活性。
核糖体组装异常,小亚基积累未成熟蛋白,大亚基减少,早期加工因子异常富集,表明甲基化缺失使核糖体成熟和组装受阻。
四. mt-tRNAPhe和mt-tRNAVal的加工促进早期核糖体组装
mtF和mtV作为结构性tRNA参与线粒体核糖体组装。mitoSAM缺失时,这些tRNA和未加工rRNA积聚,导致核糖体早期组装受阻。
五. 大亚基组装依赖线粒体SAM
线粒体SAM缺失导致mtLSU组装停滞,肽酰转移酶中心未成熟,阻碍完整核糖体形成。
关键组装因子和结构性tRNA异常结合,核糖体蛋白uL16m缺失影响结构成熟,最终导致核糖体功能受损。
六. 线粒体SAM是肽酰转移酶中心成熟所必需
线粒体SAM缺失导致肽酰转移酶中心(PTC)部分无序,阻碍PTC关键环状结构的甲基化和重塑,进而妨碍GTPBP5结合和PTC成熟,最终抑制线粒体大亚基的组装和功能。
总结
本研究发现S-腺苷甲硫氨酸(SAM)是细胞主要的甲基供体,在线粒体基因表达中关键,揭示了SAM对线粒体rRNA加工和大亚基成熟的重要作用,连接了细胞甲基化能力与线粒体翻译功能。
我们能够针对微量细胞或组织,如卵母细胞、卵巢、临床穿刺样品等产出高质量翻译组数据结果。
超高的准确性为研究非经典的开放阅读框(ORFs)提供极大便利,提高微肽(肿瘤新生抗原)的挖掘效率。
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