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助力健康
发掘疾病靶点
新使生物旨在为研究者提供强大的工具
NCB | Ribo-seq应用:王芳/钱鹏旭/余佳团队揭示NAT10通过非催化功能维持造血干细胞稳态
05-06
导读造血干细胞(HSC)是研究干细胞维持的经典体系,它在整个生命周期中持续补充循环血细胞。HSC的自我更新与分化平衡对维持造血稳态至关重要,这一过程由一个精确调控的基因表达程序所控制。已有研究揭示了HSC必需基因的表达程序受到表观遗传修饰、转录因子和蛋白质降解等多种机制的调控。在...
综述 | 血红素调节激酶HRI——连接翻译调控与人类疾病的分子节点
05-05
导读血红素调节抑制剂(HRI)曾被长期认为仅限于调节红细胞中血红素与珠蛋白的合成平衡。然而,随着研究的深入,这一经典的eIF2α激酶已被重新定义为一个多维度的细胞稳态传感器。它不仅在应对线粒体应激、细胞质蛋白折叠压力中发挥核心作用,还深度参与了先天免疫、神经生物学稳态及肿瘤抑制过程...
Sci Adv | Poly(A)尾测序应用:调控MASLD进展的转录后重编程机制
05-04
导读代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)已成为全球范围内极其普遍的慢性肝病,影响着近20亿人的健康。该疾病包含从单纯性肝脂肪变性(SLD)到严重的代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)的连续演变过程。长期高脂肪饮食摄入诱导的代谢压力是推动MASLD发生及其向肝硬化和肝细胞癌进展...
NAR | Ribo-seq应用:计算预测辅助蛋白质组学揭示植物中广泛的非AUG翻译起始事件
05-03
导读蛋白质翻译是遗传信息表达的关键环节,精细调控着生物体内蛋白质合成的种类与水平。在传统的真核生物翻译模型中,核糖体通常识别编码序列起始端的AUG密码子来启动翻译过程。然而,近年来的研究打破了这一固有认知,揭示了多种非规范翻译事件在生物界中的普遍存在。其中非AUG翻译起始作为一种...
Nature | Polysome profiling应用:抗CRISPR蛋白介导的cas12 mRNA翻译依赖性降解
05-02
导读细菌进化出多种防御系统,包括CRISPR-Cas系统,以识别并切割噬菌体及其他移动遗传元件的DNA。作为反制措施,噬菌体编码抗CRISPR(Acr)蛋白,通过阻断DNA结合或切割来抑制CRISPR-Cas活性。大多数已知的Acr蛋白通过直接结合核糖核蛋白复合物来抑制其功能,或者通过酶促...
Sci Adv | Ribo-seq应用:AMD1 C-末端尾部停滞肽介导的核糖体停滞机制
05-01
导读细胞通过调节蛋白质合成的各个步骤来响应环境变化和代谢需求,以确保生存。核糖体能够主动感知mRNA通道或多肽出口通道中的序列元件,从而控制基因表达。多胺是调节细胞生长和增殖所必需的阳离子分子,其代谢酶的翻译受到严格调控。AMD1作为多胺生物合成的关键酶,其翻译效率受到多种机制的精...
NAR | Ribo-seq应用:多组学图谱揭示假尿苷修饰模式与密度依赖性翻译调控机制
04-30
导读假尿苷(Ψ)是由尿苷异构化形成的一种丰富的RNA修饰。它存在于包括mRNA在内的多种RNA中,并被证实参与调控翻译保真度、RNA结构稳定性及前体mRNA加工等过程。以往研究表明,Ψ修饰能够促进核糖体通读过早终止密码子,从而恢复全长蛋白的合成。然而,由于现有的修饰图谱不一致,且缺...
NAR | Polysome profiling应用:北大郭强团队发现rRNA扩展片段在核糖体二聚化中介导保守的应激响应
04-28
导读蛋白质翻译是生命活动的核心过程,涉及起始、延伸、终止和回收等多个关键阶段。在细胞面临蛋白稳态应激时,抑制信使RNA(mRNA)的翻译是一种普遍存在的生理保护机制。嘌呤霉素作为研究翻译的常用工具,通过模拟氨酰-tRNA的3’端诱导翻译提前终止。尽管应用广泛,但嘌呤霉素诱导的翻译应激...
综述 | 既管转录又管翻译:核糖核酸酶血管生成素的多重调控机制
04-27
导读核糖核酸酶(RNase)通过介导RNA加工和降解来塑造基因表达。这些酶在维持细胞稳态和促进不同环境条件下的动态适应中发挥着不可或缺的作用。随着对各种RNase底物谱认识的不断深入,它们在协调不同基因表达环节中的交互作用逐渐被认可。部分多功能RNase能够针对多种RNA底物进行切割,从而...
综述 | 病毒与核糖体质量控制:一场围绕翻译展开的分子博弈
04-26
导读作为专性细胞内寄生生物,病毒完全依赖宿主的mRNA翻译机制来合成其蛋白质。病毒mRNA的翻译会大量消耗宿主资源并施加结构限制,从而引发翻译应激。翻译应激会激活细胞的监视反应,包括核糖体相关质量控制(RQC)、整合应激反应(ISR)、核糖体毒性应激反应(RSR)和先天性免疫反应(...
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