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PNAS | 翻译延伸因子eEF1A乳酰化促进蛋白质合成与结肠癌的发生

来源:时间:2024-04-30 15:39

导读

乳酸是有氧糖酵解的副产物,但也参与表观遗传修饰,如赖氨酸乳酰化(Kla),Kla直接影响基因转录和免疫细胞稳态。在病理情况下,高水平的Kla与多种疾病相关。在肿瘤中,乳酸释放增加,形成酸性肿瘤微环境,促进肿瘤生长并影响免疫。

翻译延伸因子1A(eEF1A)是真核蛋白组中最丰富和保守的蛋白之一。作为翻译延伸的调节因子,eEF1A在蛋白质合成过程中促进核糖体与氨酰tRNA的结合。

目前已知eEF1A2参与肿瘤发生和癌症发展:

A)eEF1A2的重新激活刺激磷脂信号传导,并促进依赖Akt的细胞迁移和肌动蛋白重塑,最终有利于肿瘤发生。

B)eEF1A2通过后转录修饰促进肿瘤进展。eEF1A2甲基化作为肿瘤适应其增强的翻译需求的机制。由于转录后修饰是简单高效的调节蛋白质功能的方法,是否存在其他参与eEF1A2介导的肿瘤调节的转录后修饰还有待研究。

2024年2月15日,北京协和医学院浦洋团队在PNAS上发表了一篇题为“KAT8-catalyzed lactylation promotes eEF1A2-mediated protein synthesis and colorectal carcinogenesis”的论文,文章发现eEF1A2乳酰化有助于提高蛋白质合成,从而促进肿瘤生长,揭示了一种Kla介导的肿瘤适应异常翻译需求的机制,并确定了KAT8作为一个可在癌症治疗中靶向的Kla写入体,为癌症治疗提供了潜在靶点。

文章索引

【标题】KAT8-catalyzed lactylation promotes eEF1A2-mediated protein synthesis and colorectal carcinogenesis

【发表期刊】PNAS

【发表日期】2024年2月15日

【作者及团队】北京协和医学院浦洋团队

【IF】9.66

研究结果


 一. 全局乳酰化水平升高与肿瘤进展及结直肠癌患者的不良预后相关

Warburg效应是癌症的标志之一,其副产物乳酸被视为结直肠癌(CRC)患者预后的指标。

作者发现在结直肠癌组织中,全局乳酰化水平与癌症侵袭性和患者预后相关。结直肠癌细胞和肿瘤样本中的乳酸水平与乳酰化程度密切相关,说明乳酸是调节乳酰化的关键因素。

糖酵解抑制剂降低了乳酸水平和乳酰化水平,并抑制了癌细胞增殖。这些发现揭示了乳酸调节细胞增殖的机制并为结直肠癌的发生和进展提供了新视角。


二. 结直肠癌中eEF1A2发生高乳酰化

作者在结直肠癌组织中发现了超过1200个蛋白质乳酰化位点,涉及约850个蛋白质,不仅局限于细胞核,还分布在细胞质等位置,显示乳酰化作用广泛。

结直肠癌组织中的乳酰化水平存在变化,与翻译过程相关。他们特别关注了eEF1A2的乳酰化,该蛋白是经典的mRNA翻译因子。体外验证显示了结直肠癌细胞中eEF1A2的乳酰化,进一步证实了这一结果。

三. eEF1A2的乳酰化促进了肿瘤细胞的增殖


通过结直肠癌(CRC)活检、质谱分析显示,eEF1A2的主要乳酰化位点是赖氨酸残基408。作者通过将K408突变为R来模拟eEF1A2的乳酰化,发现K408R突变导致Kla显著减少。

研究团队进一步预测了eEF1A2K408R突变的结构,发现与原始结构相比没有明显的构象变化。体内外实验都证实,eEF1A2K408la促进了CRC细胞的增殖。

四. eEF1A2的乳酰化介导了细胞中增强的蛋白质合成

eEF1A2是一个重要的GTP酶,在蛋白质合成过程中招募氨基酰-tRNA到核糖体A位点。作者发现,eEF1A2的K408乳酰化并不改变其基础GTP酶活性,但在aa-tRNA刺激下,K408乳酰化状态下的eEF1A2催化效率显著提高。这表明,eEF1A2 K408乳酰化增加了其在aa-tRNA刺激下的GTP酶活性,可能促进了翻译延伸,从而增加了蛋白质合成。

在细胞中重建了wt/delac-eEF1A2后,他们发现在乳酸钠存在下,delac-eEF1A2细胞中核糖体run-off减少了1.5倍,强调了eEF1A2K408la在维持肿瘤细胞中的延伸速率方面的重要性。


重建了wt-eEF1A2的细胞显示了比重建了delac-eEF1A2的细胞更高的蛋白质合成水平。这些结果表明,eEF1A2K408la促进了翻译延伸,增强了CRC细胞的蛋白质合成。

五. 确定KAT8为eEF1A2 K408的乳酰转移酶

作者通过质谱分析发现,KAT8是eEF1A2的潜在乳酰化调控因子。KAT8过表达导致eEF1A2的乳酰化水平显著增加,而KAT8敲除则减少了eEF1A2的乳酰化水平。免疫共沉淀实验显示,KAT8与eEF1A2有强烈的结合作用。

体外实验表明,KAT8直接介导了eEF1A2在K408位点的乳酰化。KAT8的敲除消除了eEF1A2的乳酰化增强蛋白质合成和肿瘤细胞增殖的差异。


六. KAT8是全局蛋白质乳酰化的writer

KAT8是否是唯一的eEF1A2底物目前尚不清楚。作者消耗了KAT8并观察到CRC细胞中Kla显著减少,但乳酸水平保持不变。尽管KAT8被认为是一个乙酰转移酶,但发现在消耗KAT8后,非组蛋白中的赖氨酸乙酰化水平没有明显变化。

作者进一步发现,KAT8的MYST结构域对于其作为Kla赋码因子的活性是必需的。此外,KAT8的乳酰转移酶催化活性与其乙酰转移酶活性是独立的。

七. CRC细胞中KAT8调控的乳酰化组蛋白全景

KAT8调节结直肠癌细胞中丰富多样的乳酰化修饰。KAT8缺失显著降低了乳酰化位点,但未影响乳酸水平。

截短的KAT8实验证明其MYST结构域对乳酰化至关重要。乳酰化组学揭示了KAT8独特的靶蛋白,强调了KAT8在癌症通路中的作用。

八. KAT8缺失抑制了高乳酸环境中的肿瘤生长

作者分析了CRC患者的免疫荧光染色,并发现高KAT8表达与患者生存期呈负相关,同时与CRC组织中的全局Kla水平呈正相关。KAT8缺失降低了HCT116细胞的Kla水平,并在高乳酸环境下减弱了细胞增殖。

裸鼠实验结果显示,KAT8缺失细胞在高乳酸环境下肿瘤生长减缓,全局Kla水平降低。他们推测KAT8的乳酰-催化区位于MYST结构域内,与其乙酰-催化结构域不同。综上所述,KAT8是CRC肿瘤发展的贡献者,尤其是在高乳酸环境下。

总结

本文发现CRC中全局Kla与患者预后呈负相关。在CRC中,eEF1A2K408的乳酰化导致了翻译延长和蛋白合成的增强,促进了肿瘤发生。通过筛选eEF1A2相互作用蛋白,文章确定了KAT8是一个关键的乳酰转移酶,负责在多种蛋白底物上安装Kla。KAT8的缺失抑制了CRC的肿瘤生长,尤其是在高乳酸环境中。因此,KAT8-eEF1A2 Kla轴可能成为治疗CRC的潜在靶点。

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