Mol Cell | Ribo-seq应用：YTHDF2蛋白揭秘——癌细胞翻译加速器与化疗抗性的幕后推手

N6-甲基腺苷（m6A）是一种可逆的RNA表观遗传修饰，由METTL3/14、WTAP等甲基转移酶和FTO、ALKBH5等去甲基酶调控，参与多种生理与病理过程。

m6A识别蛋白如YTHDF1-3可调控RNA的加工、翻译与降解，YTHDF1促进翻译，YTHDF2介导降解，YTHDF3则协调两者功能。

不过，YTHDF2在某些情况下，如胶质母细胞瘤和乙肝相关肝癌中，反而稳定m6A修饰RNA，并在热休克中参与翻译调控，提示其功能复杂且依赖具体环境，其非降解相关机制尚不清楚。

卵巢癌是最致命的妇科癌症，女性癌症死亡的第五大原因。由于缺乏有效治疗，晚期卵巢癌5年生存率仅约30%。标准治疗虽包括手术和含紫杉醇的化疗，但普遍存在耐药问题，亟需新靶点以改善疗效并克服耐药。

文章索引

【IF】15.58

研究结果

一. YTHDF2在卵巢癌中的临床与功能重要性

作者通过全基因组CRISPR-Cas9筛选，发现YTHDF2在卵巢癌细胞中高表达。数据库和患者样本均显示YTHDF2与肿瘤分级和分期正相关，高表达预示预后较差。

抑制YTHDF2能显著抑制卵巢癌细胞的增殖、迁移和侵袭，并减缓裸鼠体内肿瘤生长和转移，表明YTHDF2促进卵巢癌进展。

二. YTHDF2结合m6A修饰mRNA但对其丰度影响较小

团队通过多组学分析发现，尽管YTHDF2可以结合大量m6A修饰的mRNA，但其敲除对这些转录本的丰度和稳定性影响甚微，提示YTHDF2在卵巢癌中主要承担识别功能，而非调控mRNA降解。

三. YTHDF2可与DDX1和eIF3F直接相互作用

研究发现，YTHDF2通过其C端结构域与DDX1和eIF3F直接结合，该结合不依赖于m6A识别功能。

YTHDF2与DDX1共同参与翻译起始复合物的调控，影响卵巢癌细胞的蛋白质合成过程。

四. YTHDF2与DDX1促进蛋白质合成

DDX1与eIF3F形成复合物，YTHDF2增强其结合。YTHDF2和DDX1通过RNA依赖性与PABPC1和eIF4G相互作用，参与mRNA翻译复合物。

敲低YTHDF2或DDX1均抑制蛋白质合成，恢复表达可部分逆转，表明两者协同促进卵巢癌细胞蛋白质合成。

五. YTHDF2和DDX1促进微管蛋白的翻译

作者通过Ribo-seq核糖体印迹分析发现，YTHDF2和DDX1促进m6A修饰基因的翻译，尤其是与微管和细胞周期相关的基因，其缺失导致这些基因的蛋白质表达下降但mRNA水平无显著变化，表明二者协同调控关键靶基因的翻译。

六. YTHDF2缺失抑制CKAP2翻译并增强卵巢癌细胞对紫杉醇的敏感性

YTHDF2通过结合CKAP2 mRNA的m6A位点促进其翻译，Polysome profiling多聚核糖体分析显示YTHDF2缺失减少CKAP2 mRNA在多聚核糖体上的富集。

CKAP2蛋白下降抑制OC细胞增殖和转移，且YTHDF2敲低增强紫杉醇疗效，说明YTHDF2-CKAP2轴促进卵巢癌进展。

七. 小分子抑制剂靶向YTHDF2延缓卵巢癌进展

研究团队通过高通量筛选发现小分子多潘立酮可特异性靶向YTHDF2。

Polysome profiling多聚核糖体分析证实，多潘立酮抑制了卵巢癌细胞中CKAP2的翻译，降低细胞增殖和迁移能力。它还能阻断YTHDF2与DDX1、eIF3F的结合，削弱YTHDF2对目标mRNA的作用。

多潘立酮与紫杉醇联用增强了抗癌效果，显示其作为YTHDF2抑制剂的潜力，有望用于卵巢癌治疗。

总结

本研究发现YTHDF2除促进RNA降解外，还通过与eIF3F和DDX1相互作用，增强卵巢癌细胞中微管相关蛋白mRNA的翻译，促进肿瘤进展并降低紫杉醇敏感性。另外，文章发现的小分子抑制剂靶向YTHDF2，能抑制蛋白翻译并逆转耐药。

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