PAlso-seq2技术服务

揭示poly(A)尾真实结构

RNA的尾巴,远比我们想象得复杂

mRNA 3′端的poly(A)尾长期被认为只是由一串腺苷组成的简单结构AAAAAAAAAAAAA,它的主要功能被认为参与mRNA稳定性、翻译起始及RNA出核调控。

然而,随着高分辨率测序技术的发展,研究人员逐渐意识到poly(A)尾并不是简单的“A尾巴”,而是一个高度动态、携带调控信息的RNA结构。但由于poly(A)尾属于长同聚体序列(homopolymer),传统二代测序技术难以对其准确解析,长期以来限制了相关研究的发展。

PAIso-seq2:精准解析poly(A)尾结构

新使生物(NeoRibo)依托中国科学院遗传与发育生物学研究所陆发隆研究团队,完成PAIso-seq2技术转化,正式推出包含完整poly(A)尾的全长转录组测序解决方案。

该技术基于PacBio HiFi长读长测序,实现单分子水平解析:

poly(A)尾精确长度

poly(A)尾内部碱基组成(A/U/C/G)

全长转录本结构(isoform),包含可变剪切以及加尾位点信息

Poly(A)尾检测技术比较
技术 poly(A)长度 碱基类型 全长转录本 样本需求
TAIL-seq 低精度 (仅末端) 大量
ONT DRS 中精度 低精度 超大量
FLAM-seq 高精度 (仅内部) 大量
PAIso-seq2 高精度 高分辨率 微量

PAIso-seq2是可高精度同时解析poly(A)尾长度、碱基组成、全长转录本及其异构体信息的技术方案!

连接RNA命运与翻译调控的关键枢纽

随着研究深入,poly(A)尾已被认为是决定RNA命运的重要调控层面,并直接参与翻译调控过程。

调控RNA稳定性与降解

poly(A)尾长度变化是RNA降解的重要信号。随着去腺苷化发生,mRNA稳定性下降并进入降解通路。同时,poly(A)尾末端的U和G等非A碱基进一步影响RNA稳定性。

影响翻译效率(TE)

poly(A)尾通过结合PABP促进翻译起始复合物形成,从而起始蛋白质翻译,是连接mRNA与蛋白表达的重要桥梁。

参与RNA重塑过程

在卵母细胞及早期胚胎发育中,mRNA会经历poly(A) 尾的动态重塑(脱腺苷化与再加尾),说明RNA命运可以被重新编程,该过程可能也在生殖之外的生物学过程中广泛存在。

PAIso-seq2技术应用场景

PAIso-seq2适用于多种RNA调控相关研究场景,尤其适合以下方向:

发育与生殖研究

在卵母细胞、早期胚胎等微量样本中,poly(A)尾动态变化与母源mRNA调控密切相关。PAIso-seq2可在低起始量条件下,解析poly(A)尾结构重塑过程。

肿瘤与疾病研究

在肿瘤或疾病状态下,RNA稳定性与翻译调控常发生改变。通过poly(A)尾特征分析,可挖掘异常RNA调控机制及潜在分子标志物。

植物与多物种研究

适用于植物及多种模式生物,研究不同物种中poly(A)尾调控差异及环境响应机制。

RNA降解与质量控制研究

解析脱腺苷化(deadenylation)、尿苷化(uridylation)等过程,系统研究RNA降解路径及质量控制机制。

翻译调控研究

结合Ribo-seq和Polysome profiling,从poly(A)尾到核糖体占据,实现从RNA到蛋白表达的完整调控解析。

新使生物PAIso-seq2技术优势
1. 高分辨率poly(A)解析能力(长度及碱基)
2. 全长转录本异构体解析
3. 适用于多物种(动物、植物及临床样本)
4. 支持细胞和组织样本
5. 可针对微量起始样本(卵母细胞)
全方位翻译组学与RNA调控解决方案

新使生物专业翻译组学平台,构建了覆盖RNA调控的翻译多组学技术体系:

1.高分辨率Ribo-seq:解析核糖体占据与翻译动态 

2.Polysome profiling:评估翻译活性与mRNA分布状态

3.RNC-seq:捕获核糖体结合RNA,反映翻译进行中的转录本

4.tRNA-seq:解析翻译系统的解码能力

5. PAIso-seq:解析poly(A)尾长度与组成,连接mRNA稳定性与翻译效率

6.GLORI-seq:m⁶A绝对定量检测,探究RNA修饰对翻译调控的影响

通过多组学整合,可以系统解析poly(A)尾→mRNA稳定性→翻译效率→蛋白表达的过程,从而更加深入理解RNA调控与翻译机制。
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