tRNA(transfer RNA)是连接遗传信息与蛋白质合成的核心分子,负责将mRNA上的密码子转化为对应的氨基酸,是翻译过程中的“解码器”。
近年来越来越多研究表明,tRNA并非背景分子,而是参与翻译调控、代谢适应及疾病发生的重要调控节点。
在过去几年,翻译组学快速发展,我们已经可以通过Ribo-seq精确看到哪些mRNA在被翻译、翻译效率如何,以及密码子如何被解析,但一个关键问题始终被忽略——翻译是否具备足够的解码能力来顺利进行。而这一能力,正是由tRNA决定的。
| 层级 | 技术 | 含义 |
|---|---|---|
| 转录层 | RNA-seq | 定义转录输出 |
| 翻译执行层 | Ribo-seq | 描述翻译动态 |
| 解码供给层 | tRNA-seq | 决定解码能力 |
新使生物推出tRNA-seq服务,解析翻译系统的核心维度:
tRNA-seq并非常规测序项目,其技术复杂性远高于普通RNA测序,核心挑战包括:
在tRNA-seq中,最核心的质控指标是全长率(full-length rate)。是否能够获得完整tRNA分子,直接决定数据是否可用于后续分析。
上图展示tRNA从5′到3′的覆盖情况。理想数据应整体平坦,说明测到的是完整tRNA。左侧5′端最关键:信号低,说明逆转录被阻断,大量tRNA被截断;逐渐升高并接近中部,说明能够读穿,获得完整分子。因此,5′端覆盖(左侧高度)直接反映逆转录读穿能力,是评估全长率和数据质量的核心指标。
新使生物推出的tRNA-seq项目,核心是测得准、测得全、测得深,从细胞质到线粒体,一次性解析整个翻译系统的解码能力。
相比传统方案,我们在全长覆盖、比对精度及修饰解析能力等关键指标上全面优化,在数据质量层面超越mim-tRNA-seq,实现整体性能提升。
有效读穿修饰、获得完整tRNA序列
实现从细胞质到线粒体、叶绿体的统一解析
升级建库策略、显著降低多重比对
全面解析修饰位点、类型及比例
定量氨酰化水平,评估真实解码能力
聚焦翻译系统的解码与调控信息,解析不同tRNA类型的组成与变化,揭示翻译系统的解码能力基础。提供:
在标准版基础上,进一步解析翻译系统的真实解码活性,即tRNA携带氨基酸的比例,反映其实际参与翻译的能力。提供: