前言
全球首发,原创技术!新使生物联手贝纳基因率先推出isoRNC-seq全长翻译本长读长测序,将翻译组学与三代长读长技术深度结合,开创翻译研究新维度。
这是首个真正意义上的全长翻译组技术,不止挖掘翻译的mRNA,还能从翻译角度寻找全长异构体(isoform)!
Q:可变剪接与异构体是什么?
同一个基因在转录后,常常会经过不同方式的可变剪接,从而产生多个不同版本的转录本,这些不同版本就被称为异构体(isoforms)。不同异构体可能编码出结构和功能差异显著的蛋白,在癌症等疾病中,某些异常异构体往往成为驱动疾病发生发展的关键因素。
技术原理
本技术通过蔗糖垫超速离心富集与核糖体结合的mRNA,从而捕获处于翻译状态的转录本。采用Nanopore长读长测序(CDNA建库),一次性获取完整的转录本序列,包括外显子结构、可变剪接信息以及全长异构体isoform的组成。
早在此前,我们推出了RNC-seq技术服务(二代测序版),通过蔗糖垫离心捕获核糖体结合的mRNA,再结合二代测序,实现了正在被翻译的转录本检测。这一技术帮助研究者解析了翻译状态下的转录组,为理解基因表达调控提供了重要工具。
如今,新使生物将RNC富集与三代长读长测序相结合,推出全球首个的isoRNC-seq全长翻译本长读长测序。与传统RNA-seq、RNC-seq或三代转录组测序不同,这一流程不仅能够获得转录本的全长信息,还天然携带“正在翻译”的标签,从而直接描绘出全长翻译本的分子图谱。