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tRNA:翻译系统中被忽略的关键分子
tRNA(transfer RNA)是连接遗传信息与蛋白质合成的核心分子,负责将mRNA上的密码子转化为对应的氨基酸,是翻译过程中的“解码器”。
近年来越来越多研究表明,tRNA并非背景分子,而是参与翻译调控、代谢适应及疾病发生的重要调控节点。
在过去几年,翻译组学快速发展,我们已经可以通过Ribo-seq精确看到哪些mRNA在被翻译、翻译效率如何,以及密码子如何被解析,但一个关键问题始终被忽略——翻译是否具备足够的解码能力来顺利进行。而这一能力,正是由tRNA决定的。
层级 | 技术 | 含义 |
转录层 | RNA-seq | 定义转录输出 |
翻译执行层 | Ribo-seq | 描述翻译动态 |
解码供给层 | tRNA-seq | 决定解码能力 |
新使生物推出tRNA-seq服务,解析翻译系统的核心维度:
tRNA类型组成(Type composition)
tRNA丰度(Abundance)
tRNA修饰(Modification)
tRNA氨酰化状态(charged tRNA)
tRNA-seq并非常规测序项目,其技术复杂性远高于普通RNA测序,核心挑战包括:
1) 修饰情况复杂 → 产生大量短reads,数据失真
2) tRNA高度同源 → 多重比对严重,难以精准定量
3) 二级结构稳定 → 影响逆转录,难以获得全长序列在tRNA-seq中,最核心的质控指标是全长率(full-length rate)。是否能够获得完整tRNA分子,直接决定数据是否可用于后续分析。

各类tRNA-seq方法全长率比较
新使生物tRNA-seq技术优势
新使生物推出的tRNA-seq项目,核心是测得准、测得全、测得深,从细胞质到线粒体,一次性解析整个翻译系统的解码能力。
相比传统方案,我们在全长覆盖、比对精度及修饰解析能力等关键指标上全面优化,在数据质量层面超越mim-tRNA-seq,实现整体性能提升。
1. 高全长率(Full-length)

有效读穿修饰、获得完整tRNA序列
2. 高唯一比对率(Unique mapping)

升级建库策略 、显著降低多重比对
3. 修饰解析能力

全面解析修饰位点、类型及比例
4. 支持charged tRNA检测

定量氨酰化水平,评估真实解码能力
5. 覆盖线粒体tRNA/叶绿体tRNA

实现从细胞质到线粒体、叶绿体的统一解析
新使生物提供2项tRNA-seq服务
围绕翻译系统解码能力分级,提供从标准到进阶的2项完整解决方案:
➤ 标准版tRNA-seq
聚焦翻译系统的解码与调控信息,解析不同tRNA类型的组成与变化,揭示翻译系统的解码能力基础。提供:
tRNA表达水平(abundance)
tRNA修饰状态(类型/位点/比例)
➤ 进阶版charged tRNA-seq
在标准版基础上,进一步解析翻译系统的真实解码活性,即tRNA携带氨基酸的比例,反映其实际参与翻译的能力。提供:
tRNA表达水平(abundance)
tRNA修饰状态(类型/位点/比例)
tRNA氨酰化水平(charged tRNA)
1. 翻译调控机制:从解码层面解释翻译效率与核糖体停滞
2. 肿瘤研究:解析tRNA重编程,揭示肿瘤异常翻译
3. 代谢与应激:检测charged tRNA,评估翻译活性变化
4. 新生抗原与小肽:解释哪些ORF更容易被高效翻译
5. 线粒体功能:解析mt-tRNA,关联能量代谢与疾病
6. 植物与叶绿体:解析光合作用相关翻译机制
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新使生物专业翻译组学平台,构建了覆盖RNA调控的翻译多组学技术体系:
1. 高分辨率 Ribo-seq:解析核糖体占据与翻译动态
2. Polysome profiling:评估翻译活性与mRNA分布状态
3. RNC-seq:捕获核糖体结合RNA,反映翻译进行中的转录本
4. tRNA-seq:解析翻译系统的解码能力
5. PAIso-seq:解析poly(A)尾长度与组成,连接mRNA稳定性与翻译效率
6. GLORI-seq:m⁶A绝对定量检测,探究RNA修饰对翻译调控的影响
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| 新使生物专业翻译组一站式服务平台 |
| 产品名称 |
tRNA-seq |

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