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tRNA-seq服务上线|全景解析翻译调控解码过程

来源:新使生物时间:2026-04-21 10:38

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tRNA:翻译系统中被忽略的关键分子

tRNA(transfer RNA)是连接遗传信息与蛋白质合成的核心分子,负责将mRNA上的密码子转化为对应的氨基酸,是翻译过程中的“解码器”。

近年来越来越多研究表明,tRNA并非背景分子,而是参与翻译调控、代谢适应及疾病发生的重要调控节点。


02
为什么要做tRNA-seq

在过去几年,翻译组学快速发展,我们已经可以通过Ribo-seq精确看到哪些mRNA在被翻译、翻译效率如何,以及密码子如何被解析,但一个关键问题始终被忽略——翻译是否具备足够的解码能力来顺利进行而这一能力,正是由tRNA决定的。

层级

技术

含义

转录层

RNA-seq

定义转录输出

翻译执行层

Ribo-seq

描述翻译动态

解码供给层

tRNA-seq

决定解码能力


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tRNA-seq关注内容

新使生物推出tRNA-seq服务,解析翻译系统的核心维度:

  • tRNA类型组成(Type composition)

  • tRNA丰度(Abundance)

  • tRNA修饰(Modification)

  • tRNA氨酰化状态(charged tRNA)


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目前tRNA-seq技术难点

tRNA-seq并非常规测序项目,其技术复杂性远高于普通RNA测序,核心挑战包括:

1) 修饰情况复杂 → 产生大量短reads,数据失真

2) tRNA高度同源 → 多重比对严重,难以精准定量

3) 二级结构稳定 → 影响逆转录,难以获得全长序列


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tRNA-seq关键质控指标:全长率

在tRNA-seq中,最核心的质控指标是全长率(full-length rate)。是否能够获得完整tRNA分子,直接决定数据是否可用于后续分析。


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各类tRNA-seq方法全长率比较


上图展示tRNA从5′到3′的覆盖情况。理想数据应整体平坦,说明测到的是完整tRNA。左侧5′端最关键:信号低,说明逆转录被阻断,大量tRNA被截断;逐渐升高并接近中部,说明能够读穿,获得完整分子。因此,5′端覆盖(左侧高度)直接反映逆转录读穿能力,是评估全长率和数据质量的核心指标。


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新使生物tRNA-seq技术优势

新使生物推出的tRNA-seq项目,核心测得准、测得全、测得深,从细胞质到线粒体,一次性解析整个翻译系统的解码能力。

相比传统方案,我们在全长覆盖、比对精度及修饰解析能力等关键指标上全面优化在数据质量层面超越mim-tRNA-seq,实现整体性能提升。



1. 高全长率(Full-length)


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有效读穿修饰、获得完整tRNA序列



2. 高唯一比对率(Unique mapping)


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升级建库策略 、显著降低多重比对



3. 修饰解析能力


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全面解析修饰位点、类型及比例



4. 支持charged tRNA检测


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定量氨酰化水平,评估真实解码能力



5. 覆盖线粒体tRNA/叶绿体tRNA


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实现从细胞质到线粒体、叶绿体的统一解析


07

新使生物提供2项tRNA-seq服务

围绕翻译系统解码能力分级,提供从标准到进阶的2项完整解决方案:


➤ 标准版tRNA-seq

聚焦翻译系统的解码与调控信息,解析不同tRNA类型的组成与变化,揭示翻译系统的解码能力基础。提供:

  • tRNA表达水平(abundance)

  • tRNA修饰状态(类型/位点/比例)


➤ 进阶版charged tRNA-seq

在标准版基础上,进一步解析翻译系统的真实解码活性,即tRNA携带氨基酸的比例,反映其实际参与翻译的能力。提供:

  • tRNA表达水平(abundance)

  • tRNA修饰状态(类型/位点/比例)

  • tRNA氨酰化水平(charged tRNA



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应用场景

1. 翻译调控机制从解码层面解释翻译效率与核糖体停滞

2. 肿瘤研究解析tRNA重编程,揭示肿瘤异常翻译

3. 代谢与应激检测charged tRNA,评估翻译活性变化

4. 新生抗原与小肽解释哪些ORF更容易被高效翻译

5. 线粒体功能解析mt-tRNA,关联能量代谢与疾病

6. 植物与叶绿体解析光合作用相关翻译机制


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全方位翻译组学与RNA调控解决方案

新使生物专业翻译组学平台,构建了覆盖RNA调控的翻译多组学技术体系:

1. 高分辨率 Ribo-seq:解析核糖体占据与翻译动态

2. Polysome profiling:评估翻译活性与mRNA分布状态

3. RNC-seq:捕获核糖体结合RNA,反映翻译进行中的转录本

4. tRNA-seq:解析翻译系统的解码能力

5. PAIso-seq:解析poly(A)尾长度与组成,连接mRNA稳定性与翻译效率

6. GLORI-seq:m⁶A绝对定量检测,探究RNA修饰对翻译调控的影响


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销售区域:中国、亚太地区、美国

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产品名称

超高分辨率Ribo-seq

超高分辨率Disome-seq

Polysome profiling多聚核糖体分析

Polysome-seq
酶切Polysome profiling
RNC-seq(2代测序)

isoRNC-seq(3代测序)

肿瘤新生抗原挖掘与鉴定

PAIso-seq2(Poly(A)尾测序)

tRNA-seq

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新使生物NeoRibo推出国内首个低起始量超高分辨率翻译组Ribo-seq服务
开创性的建库技术使得Ribo-seq核糖体印迹分析(QEZ-seq®)具有超高的分辨率且适用于哺乳动物、植物、真菌等多类物种。
我们能够针对微量细胞或组织,如卵母细胞、卵巢、临床穿刺样品等产出高质量翻译组数据结果。
超高的准确性为研究非经典的开放阅读框(ORFs)提供极大便利,提高微肽(肿瘤新生抗原)的挖掘效率。
另外新使生物提供多物种多聚核糖体分析(Polysome profiling),了解更多翻译组技术信息可登录 www.neoribo.com

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