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Cell Rep | Ribo-seq应用:通过突变型KRAS驱动的翻译图谱重构探索癌症治疗的新策略

来源:新使生物时间:2026-06-18 09:25

导读

mRNA翻译是细胞内精确调节蛋白质水平并响应生理信号的关键生物学过程。在肿瘤发生过程中,翻译效率的异常提升和核糖体生物合成的增强是维持恶性增殖的核心特征。突变型KRAS作为多种癌症中常见的致癌驱动因子,通过激活MAPK/ERK和PI3K/AKT/mTOR等信号通路,显著影响帽依赖性mRNA的翻译水平。

尽管针对KRASG12C等突变体的抑制剂已在临床取得突破,但突变型KRAS具体如何选择性重构翻译景观的机制仍不明确。深入探究KRAS抑制后的翻译组早期变化及其诱导的细胞适应性,对于理解药物作用机制至关重要。

目前尚缺乏关于突变型KRAS如何通过特定转录本特征调控翻译程序的系统性研究,这一缺口限制了针对癌症翻译调控靶点的疗法开发。因此,阐明突变型KRAS驱动的选择性翻译机制对发现新的治疗脆弱性具有重要意义。

2026年6月17日,阿尔伯特·爱因斯坦医学院的Kamini Singh团队在Cell Reports上发表了题为 “Mutant KRAS-driven selective mRNA translation reveals mechanisms and therapeutic vulnerabilities in cancer” 的研究论文。本研究发现突变型KRAS选择性地调控具有短且弱结构化5’ UTR的mRNA翻译,其抑制剂会诱导核糖体停滞从而减慢翻译过程。

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文章索引

【标题】Mutant KRAS-driven selective mRNA translation reveals mechanisms and therapeutic vulnerabilities in cancer

【发表期刊】Cell Reports

【发表日期】2026年6月17日

【作者及团队】阿尔伯特·爱因斯坦医学院的Kamini Singh团队

IF】6.9


研究结果

一、突变型KRAS调控特定的mRNA翻译程序

研究利用Ribo-seq核糖体印迹分析技术,分析了急性抑制突变型KRAS后全基因组范围内的翻译效率变化。

结果显示,KRAS抑制剂显著降低了特定mRNA子集的翻译效率,并导致核糖体在这些转录本上的覆盖率下降,表明突变型KRAS对维持特定翻译程序至关重要。

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二、KRAS抑制剂诱导翻译起始阻滞与核糖体停滞

Ribo-seq核糖体印迹分析显示,KRAS抑制剂导致核糖体在翻译起始位点积累,且KRAS G12C抑制剂还会诱导核糖体在延伸阶段发生停滞和碰撞。

通过Polysome profiling多聚核糖体分析及对核糖体碰撞标志物的检测,进一步证实了这种翻译应激反应的发生。

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三、突变型KRAS控制翻译机器的蛋白质水平

系统分析显示,突变型KRAS抑制剂主要下调了参与翻译起始和延伸的关键因子的翻译效率。

体内外实验证实,这些因子的蛋白质水平在抑制KRAS后显著降低,且这种调控不依赖于转录水平的变化。

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四、5' UTR的结构特征决定了翻译对KRAS的依赖性

序列分析表明,受突变型KRAS调控的mRNA通常具有较短的5' UTR和较低的折叠能,且包含类似内部核糖体进入位点IRES)的结构。

通过突变实验证实,这些特定的5' UTR结构是KRAS抑制剂介导翻译抑制的关键决定因素。

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五、KRAS、mTOR与EIF4A在翻译调控中具有互补作用

通过对比发现,KRAS、mTOR和EIF4A分别调控不同的mRNA子集,且KRAS与EIF4A对相同转录本的调控方向往往相反。

联合抑制这些通路在多种胰腺癌细胞系中表现出增强的细胞毒性,证明了它们在翻译调控中具有独立且互补的功能。

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总结

本研究阐明了突变型KRAS通过调控具有特定5' UTR特征的mRNA子集来驱动蛋白质合成的独特机制,并揭示了其与mTOR及EIF4A通路在翻译调控上的功能解耦。通过联合靶向这些关键翻译节点,研究为克服癌症治疗中的翻译适应性及耐药性提供了强有力的理论依据和潜在的临床干预策略。

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产品名称

超高分辨率Ribo-seq

超高分辨率Disome-seq

Polysome profiling多聚核糖体分析

Polysome-seq
酶切Polysome profiling
RNC-seq(2代测序)

isoRNC-seq(3代测序)

肿瘤新生抗原挖掘与鉴定

PAIso-seq2(Poly(A)尾测序)
tRNA-seq
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