Cell Rep丨Ribo-seq应用：EBV编码的snoRNA通过rRNA甲基化调控翻译与病毒裂解

EBV是一种普遍存在的人类γ-疱疹病毒，全球超过90%的成年人被感染。该病毒与多种恶性肿瘤（如伯基特淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤）和自身免疫性疾病的发生密切相关。

EBV主要感染B淋巴细胞和上皮细胞，并在其中建立终身潜伏感染。在潜伏期，病毒基因组以核内附加体的形式存在，表达一组有限的病毒产物来促进宿主细胞增殖、抑制凋亡并逃避免疫监视。

此外，EBV基因组还编码多种非编码RNA，包括一个推定的小核仁RNA（v-snoRNA1）。然而，这些病毒非编码RNA，特别是v-snoRNA1，在病毒感染中的具体分子功能和生理作用尚未被完全阐明。

2026年8月28日，法国图卢兹大学Tamás Kiss和耶路撒冷希伯来大学Daphna Nachmani团队在Cell Reports上发表了题为“An Epstein-Barr virus-encoded snoRNA directs 2’-O-methylation of human rRNAs to control translation and the viral lytic switch”的研究论文。本研究发现，EBV编码的v-snoRNA1可引导宿主rRNA在18S-C621和28S-U1760位点发生2′-O-甲基化，导致核糖体缺陷和翻译异常，进而重塑基因表达，精细调控病毒裂解开关并促进病毒颗粒产生。  

文章索引

【标题】An Epstein-Barr virus-encoded snoRNA directs 2' -O- methylation of human rRNAs to control translation and the viral lytic switch

【发表期刊】Cell Reports

【发表日期】2026年8月28日

【作者及团队】法国图卢兹大学Tamás Kiss和耶路撒冷希伯来大学Daphna Nachmani团队

【IF】7.7

研究结果

一、v-snoRNA1可定向引导宿主rRNA的2′-O-甲基化

研究者通过序列互补性分析预测，v-snoRNA1的两个反义元件分别可与18S rRNA和28S rRNA配对，从而定位18S-C621和28S-U1760两个潜在甲基化位点。

通过稳定表达野生型或反义序列突变型v-snoRNA1、低dNTP引物延伸和碱水解保护实验，证实野生型v-snoRNA1可特异性引导这两个位点发生2′-O-甲基化。 

二、v-snoRNA1介导的rRNA高甲基化损害核糖体生成和翻译功能

采用HPG新生蛋白标记、Polysome profiling多聚核糖体分析、Northern blot、双荧光素酶错译报告系统及SunRiSE实验，研究者发现v-snoRNA1表达可降低总体蛋白合成、减少40S核糖体亚基比例并减慢翻译延伸。

v-snoRNA1还导致18S-E前体rRNA积累、成熟18S rRNA减少，同时增加终止密码子通读和氨基酸错误掺入，提示其造成兼具核糖体生成障碍和翻译保真度下降的核糖体缺陷状态。

三、EBV感染相关的rRNA甲基化与翻译抑制及增殖减慢相关

RiboMethSeq分析显示，在EBV阳性的伯基特淋巴瘤细胞及EBV转化的淋巴母细胞系中，18S-C621和28S-U1760的甲基化水平升高，而EBV阴性细胞中这两个位点的基础甲基化较低。

在EBV阴性的BJAB细胞中表达v-snoRNA1后，细胞出现总体翻译下降、40S亚基减少、翻译延伸减慢和竞争性增殖能力下降，破坏任一或两个甲基化引导位点均可消除这一增殖抑制效应。

四、感染过程中v-snoRNA1抑制翻译与细胞增殖，并改变核糖体局部结构

利用野生型EBV和缺失v-snoRNA1的突变株感染原代B细胞建立细胞系，并结合多聚核糖体的冷冻电镜结构分析证实了野生型感染状态下翻译活跃的核糖体带有甲基化修饰。

相比之下，突变株感染的细胞表现出整体蛋白质合成增强及细胞增殖加快，反向印证了该修饰在抑制宿主翻译中的关键作用。

五、v-snoRNA1通过核糖体缺陷状态广泛重塑宿主基因表达网络

利用Ribo-seq核糖体印迹分析和蛋白质组学技术深度剖析感染细胞，发现v-snoRNA1的缺失导致宿主转录组和翻译组发生了大范围的全局重塑。

这种重塑不仅表现为免疫和干扰素通路的基因表达变化，还引起了调节B细胞分化（如BACH2和BLIMP1）的关键转录因子活性的显著改变。

六、v-snoRNA1介导的高甲基化核糖体有利于EBV裂解基因表达和病毒颗粒产生

针对病毒基因表达的RNA-seq和Ribo-seq核糖体印迹分析揭示，v-snoRNA1能够特异性地维持裂解期转录本的翻译效率。

在突变体感染模型中，控制潜伏-裂解开关的核心转录因子BZLF1表达量锐减，最终导致病毒外膜糖蛋白产生受阻和整体病毒颗粒产量的显著下降。

总结

本研究阐明了EBV通过编码v-snoRNA1直接修饰宿主核糖体，从而实现对宿主翻译景观的精准调控。这一机制不仅解释了病毒如何通过诱导核糖体病样状态来重塑细胞环境，还揭示了核糖体修饰在维持病毒潜伏-裂解平衡及促进病毒生产中的关键作用。