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Cell Rep | Polysome profiling应用:儿童及青年AML中CSE1L富集揭示核糖体输出依赖性

来源:新使生物时间:2026-11-02 09:26

导读

急性髓系白血病(AML)在不同年龄段的生物学特性差异显著。成人AML通常以体细胞突变和克隆性造血为特征,而儿童、青少年和年轻成人(AYA)的AML则更多地表现为结构变异和融合癌基因。

这些基因组层面的差异提示,其下游可能存在着不同的信号通路失调。尽管在儿童/AYA AML中,核孔复合物(NPC)的基因改变(如NUP98重排)更为常见,但核质转运通路在年轻AML患者中的作用及其作为治疗靶点的潜力仍未被充分研究。

因此,识别年轻AML患者中特有的、可作为治疗靶点的脆弱性通路,对于开发新的治疗策略至关重要。本研究旨在深入探究这些差异背后的分子机制,以期找到针对年轻AML患者的精准治疗靶点。

2026年11月24日,多伦多大学Grace Egan团队在Cell Reports发表了题为“CSE1L enrichment in pediatric and young adult acute myeloid leukemia reveals a ribosomal export dependency”的研究论文。该研究鉴定出核输出蛋白CSE1L在年轻AML患者中显著高表达,并揭示了其通过介导核糖体60S亚基输出维持白血病干细胞功能的关键作用。

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文章索引

【标题】CSE1L enrichment in pediatric and young adult acute myeloid leukemia reveals a ribosomal export dependency

【发表期刊】Cell Reports

【发表日期】2026年11月24日

【作者及团队】多伦多大学Grace Egan团队

【IF】7.7


研究结果

一、CSE1L在年轻AML患者中高表达且预示不良预后

研究人员通过分析BeatAML和TARGET等大型数据集发现,核质运输通路基因在40岁以下的AML患者中显著富集,其中CSE1L是表达水平最高的出口蛋白。

临床数据表明,CSE1L的高表达与较低的完全缓解率以及更短的无事件生存期(EFS)和总生存期(OS)显著相关。

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二、CSE1L缺失显著抑制白血病细胞的体外增殖和克隆能力

通过shRNA和sgRNA技术在多种AML细胞系中敲低CSE1L,研究观察到细胞生长、增殖和克隆形成能力受到严重阻碍,并伴随细胞凋亡增加。

利用3' UTR靶向的shRNA进行回补实验,证实了这种生长抑制效应是由CSE1L特异性缺失引起的。

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三、CSE1L耗竭在体内削弱白血病干细胞功能并延长小鼠生存期

在异种移植小鼠模型中,敲低CSE1L显著降低了原代AML细胞和白血病细胞系的植入能力,并延长了荷瘤小鼠的生存时间。

值得注意的是,CSE1L的耗竭并不影响正常人类脐带血造血干细胞的植入,显示了该靶点的治疗选择性。

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四、CSE1L通过Ran-GTP依赖方式介导pre-60S核糖体亚基的核出口

通过蛋白质组学BioID分析和共免疫沉淀实验,研究发现CSE1L与大核糖体亚基组分(如RPL29)存在相互作用。

实验证明CSE1L在核内与pre-60S颗粒结合,并以Ran-GTP依赖的方式将其运送至细胞质,其缺失会导致核内核糖体组分积聚。

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五、不同核运输受体对核糖体生物合成的调节具有特异性

研究对比了CSE1L、XPO1和KPNA4的功能,发现虽然三者缺失都会破坏多聚核糖体图谱并抑制蛋白质合成,但机制各异。

Polysome profiling多聚核糖体分析显示,CSE1L缺失特异性地导致60S亚基减少,而XPO1影响更为广泛,KPNA4则主要影响翻译效率而非亚基组装。

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六、核糖体亚基输出特征与儿科/AYA AML不良结局相关

分析显示,核糖体亚基出口相关基因的表达特征在年轻AML(尤其是含有NUP基因融合的亚型)中显著升高。

这一基因特征能够预测年轻患者的微小残留病(MRD)状态和长期生存率,但在40岁以上的成人患者中不具备预测价值。

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总结

本研究确定了核质运输受体CSE1L是儿科及年轻成人AML的关键发育依赖点。CSE1L通过介导pre-60S核糖体亚基的核出口来维持白血病细胞的蛋白质合成和干性,由于其在正常造血干细胞中表达极低,CSE1L有望成为针对年轻白血病患者的特异性治疗靶点。

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产品名称

超高分辨率Ribo-seq

超高分辨率Active Ribo-seq

超高分辨率Disome-seq

Polysome profiling多聚核糖体分析

Polysome-seq
酶切Polysome profiling
RNC-seq(2代测序)

isoRNC-seq(3代测序)

微蛋白/微肽/肿瘤新生抗原挖掘与鉴定
PAIso-seq2(Poly(A)尾测序)
tRNA-seq
tsRNA-seq

GLORI-seq 2.0/3.0 (m⁶A单碱基绝对定量检测)