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助力健康
发掘疾病靶点
新使生物旨在为研究者提供强大的工具
NAR | 用CRISPR/Cas13X实现基因翻译调控,开启生物合成新时代!
03-11
导读合成生物学可构建微生物细胞工厂,将可再生原料转化为高价值化学品,对环境保护和循环经济具有重要意义。然而,微生物代谢网络复杂,资源优先用于细胞生长,影响目标产物产量。近年来,动态调控工具(如可诱导启动子、基因回路)被用于优化代谢流,但多局限于转录水平。事实上,相比转录,翻译调控...
NC | Ribo-seq应用:细胞压力下的生存法则——Grr1如何助力HAC1 mRNA剪切与翻译?
03-07
导读核糖体泛素化是翻译质量控制的关键修饰,涉及新生多肽(RQC)、mRNA(NGD)及非功能性rRNA(18S NRD)降解。在RQC中,酵母Hel2和哺乳动物ZNF598泛素化小亚基蛋白uS10,RQT复合物识别K63-连接的多聚泛素链,促进核糖体解离。哺乳动物的hRQT复合物执行相似功能,表明...
NC | Polysome profiling应用:解密植物应激反应——AP-3β如何帮助拟南芥清除热诱导的应激颗粒
03-04
导读植物在应激下会形成应激颗粒(SGs)来保护mRNA-核糖体复合物,解除应激后SGs解体,恢复翻译过程。因此,解析SGs解体机制对生长恢复至关重要。酵母和哺乳动物中,SGs清除由自噬、p97/Cdc48/VCP和26S蛋白酶体调控,不同应激诱导不同泛素化模式,K63-连接的泛素链促进SGs解体。植物...
Mol Ther Nucl Acids | AU富集元素如何促进蛋白质表达,提升mRNA翻译效率
02-28
导读COVID-19 mRNA疫苗的快速设计和开发标志着一种新型生物技术平台的出现,其具有应对SARS-CoV-2以及其他病原体和癌症的潜力。mRNA治疗的优势在于高效性、安全性和较低生产成本,关键在于优化mRNA序列以提升翻译效率,最大化治疗蛋白的表达。优化UTR(非翻译区)序列是提升mR...
Cell Rep | Polysome profiling应用:饥饿时,TIA1和Npl3如何协作启动细胞自我清理机制?
02-25
导读自噬是一个进化上保守的分解代谢过程,能通过降解细胞质中的物质来维持细胞稳态,清除损伤的细胞器和错误折叠的蛋白质,从而防止癌症、神经退行性疾病等病症的发生。自噬的过程需精细调控以避免不必要的细胞质分解。多种营养应答因子通过转录和翻译层面调控自噬基因的表达,调节自噬过程。Atg1/U...
NC | Ribo-seq揭示HIV-1的隐藏抗原,为疫苗研究开辟新天地
02-21
导读人类基因组的开放阅读框(ORF)长期以来通过经典标准进行注释,要求具有AUG和终止密码子,并能编码超过100个氨基酸。近期研究发现,成千上万的小ORF(sORF)编码的多肽或微蛋白质通常小于100个氨基酸,并广泛分布在基因组中,尤其是5'非翻译区(UTR)。这些sORF对DNA修复...
Mol Cell | Ribo-seq应用:揭秘整合应激反应如何调控哺乳动物的18S非功能性rRNA衰变
02-18
导读核糖体通过小亚基的解码中心和大亚基的肽酰转移酶中心调控基因表达。在酿酒酵母中,影响18S或25S rRNA的突变通过非功能性rRNA降解(NRD)途径下调,分为18S NRD和25S NRD。尽管这已在酿酒酵母中发现,但NRD的机制在哺乳动物中尚不清楚。细胞应对压力时,会通过eIF2α磷酸化...
NCB | Polysome profiling应用:揭秘癌症翻译密码——RBM42如何精准调控致癌基因表达
02-14
导读癌基因mRNA编码的蛋白剂量严格受控,以维持正常细胞稳态,而癌细胞则依赖高水平的癌基因蛋白以促进生长和生存。其中,Myc作为关键转录因子,在癌症中需维持高表达,对肿瘤发生至关重要,但其转录后调控机制仍不清楚。5′ UTR介导的转录本特异性翻译控制可能是调节Myc表达的关键。尽管5′ U...
NAR | Ribo-seq应用:揭秘线粒体无5' UTR mRNA翻译——起始tRNA和密码子的选择如何影响能量生成
02-11
导读哺乳动物线粒体具有独特的蛋白质合成系统,专门合成氧化磷酸化复合体的13个亚基。其翻译机制类似于细菌,但已演化出特异性功能,如合成疏水性膜蛋白并促进共翻译膜插入。翻译因子虽保留细菌同源核心结构,但常有额外序列,以增强与核糖体、tRNA和mRNA的特异性相互作用。线粒体DNA编码13种...
Mol Cell | Ribo-seq应用:METTL1——超越甲基转移酶,促进tRNA氨酰化与癌变!
02-07
导读癌症基因组是由突变塑造的,这些突变改变了DNA的序列或结构,并伴随着肿瘤演化。对单个基因反复突变的识别推动了致癌基因和肿瘤抑制基因的发现,但多基因遗传损伤(如染色体数目异常或局部拷贝数改变)在癌症中普遍存在,目前尚不清楚哪些基因驱动肿瘤演化,哪些为“乘客基因”。这种区分对癌症...
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