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助力健康
发掘疾病靶点
新使生物旨在为研究者提供强大的工具
NC | Poly(A)尾测序应用:NMD途径通过识别短poly(A)尾调控非经典靶标mRNA的降解
05-17
导读无义介导的mRNA降解(NMD)是一条在真核生物中高度保守的重要细胞质质控途径。它通过清除含有提前终止密码子(PTC)的异常转录本来防止产生具有潜在危害的截短蛋白。Upf1是该途径的核心因子,也是一种依赖于ATP的RNA解旋酶。在酵母中,Upf1-23复合物与翻译释放因子相互作用以促进...
PLOS Biol. | Ribo-seq应用:生命不可承受之“重”,多余的染色体为何导致细胞未老先衰?
05-16
导读染色体数目异常(非整倍体)是哺乳动物发育过程中的严重障碍,也是导致人类不孕不育的主要原因之一。唐氏综合征是由21号染色体三体引起的,它是唯一能存活至成年的人类常染色体非整倍体疾病。尽管医疗水平不断进步,但唐氏综合征患者仍面临严重的早衰问题,包括组织退化、神经退行性病变及寿命缩短...
Nature Plants | Ribo-seq应用:张秀任/何川团队揭示CDS-m⁶A 驱动共翻译RNA降解以缓解内质网应激
05-15
导读内质网是真核生物蛋白质合成、折叠及质量控制的核心场所,对于维持细胞内稳态至关重要。当环境发生波动时,内质网极易受到干扰,进而引发内质网应激。为了应对这种压力,真核生物进化出了未折叠蛋白反应(UPR)和内质网相关降解(ERAD)途径,通过上调分子伴侣和清除错误折叠蛋白来恢复平衡...
BMC Biol. | Ribo-seq应用:陈明明团队揭示eIF2B介导海稻HD961耐盐性的翻译调控机制
05-14
导读水稻作为全球过半人口的主食,其稳定生产对于保障粮食安全和经济稳定具有至关重要的作用。然而全球约有20%的灌溉农田受到土壤盐渍化的威胁,这一数字还因海平面上升和气候变化等因素不断攀升。土壤高盐环境会引发水稻渗透应激和离子毒性并严重影响其关键生长阶段,最终导致产量大幅下降。尽管传统育...
Cell Stem Cell | Ribo-seq应用:山中伸弥团队揭示eIF4G2介导的翻译调控维持成体肠道干细胞特性
05-13
导读蛋白质翻译起始过程在发育、应激反应和组织再生等生命活动中会发生重塑,并通过选择性地改变蛋白质产出来快速重塑细胞状态。eIF4G2是一种非经典的eIF4G家族翻译起始因子。此前的研究暗示eIF4G2参与了对特定mRNA的选择性翻译,这些mRNA通常具有结构化的5’非翻译区(5'UTR)或...
Zool Res | Ribo-seq应用:王治娟/张美佳揭示雄性生殖细胞特异性缺失Eif5引发精原祖细胞凋亡机制
05-12
导读精子发生是一个高度协调且受严格调控的发育程序,持续于雄性的整个生命周期。在这一过程中,精原干细胞通过有丝分裂实现自我更新或分化为祖精原细胞,进而发育为精母细胞。蛋白质翻译的精准时空调控对精原细胞的增殖、分化及减数分裂的顺利完成至关重要。真核翻译起始过程由一系列因子(eIFs)协...
NCB | Polysome profiling应用:非典型E3连接酶HOIL-1在细胞应激期间保护核糖体稳态
05-11
导读核糖体已成为一个重要的信号中心,能够感知代谢紊乱并协调细胞响应,以恢复体内平衡或启动细胞死亡。然而,通过核糖体发出信号的损伤范围以及控制细胞命运决定的机制仍未完全阐明。许多此类威胁最终都会汇聚到整合应激反应(ISR)上,在此过程中,整体蛋白质翻译被抑制,而转录因子ATF4则被选...
Science | tRNA-seq应用:人类DHX29通过检测非最优密码子使用调控mRNA稳定性
05-10
导读遗传密码具有简并性,多个同义密码子编码同一种氨基酸,但它们在功能上并不等同。同义密码子的使用会显著影响mRNA的稳定性和翻译效率,这种现象在不同物种中普遍存在。富含最优密码子的mRNA通常表现出较高的稳定性和翻译效率,而富含非最优密码子的mRNA则会被快速降解。翻译与mRNA降解...
Nature | Ribo-seq应用:挖掘生命“暗物质”,微蛋白和Peptideins开启蛋白质组学新大陆
05-09
导读表征蛋白质编码基因组是研究人类健康的基础,也是一项重大的科学目标。蛋白质编码基因是生物医学研究的基石,绝大多数药物开发项目都以此为基础。然而,人类基因组是否编码了远超约19500个经典蛋白质编码基因一直存在激烈争论。近十年来,科学家们在多种人类细胞类型和疾病状态下观察到非经典开放阅...
Adv Sci | Ribo-seq应用:THUMPD1通过IGF2R依赖性铜死亡抑制肺腺癌进展
05-08
导读肺腺癌(LUAD)是全球癌症相关死亡的主要原因之一,其预后与诊断时的临床分期密切相关,晚期患者的生存率极低。尽管靶向治疗和免疫治疗取得了一定进展,但晚期或转移性肺腺癌的治疗效果仍不理想,因此亟需寻找新的预后生物标志物并阐明其发病机制。N4-乙酰胞苷(ac⁴C)是一种重要的RNA修...
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