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助力健康
发掘疾病靶点
新使生物旨在为研究者提供强大的工具
CDD | Polysome profiling应用:空气污染物PM2.5通过影响PGK1的翻译,促进非小细胞肺癌的恶性进展
12-25
导读PM2.5空气污染是全球健康问题,含有无机物和有机物,其中PAHs占80%,与肺癌的发病率和死亡率增加密切相关,被列为Ⅰ类致癌物。PM2.5的不良肺部效应机制包括炎症、表观遗传修饰、氧化应激和DNA损伤,但多集中于急性细胞损伤,针对其在非小细胞肺癌(NSCLC)中的作用研究较少。RNA...
Cell Rep | Ribo-seq应用:翻译因子Ded1和Dbp1在翻译调控和应激反应中的差异性作用
12-20
导读DEAD-box ATP酶是调控RNA的关键蛋白,功能包括mRNA降解、核糖体生成、mRNA输出和翻译起始。它们被称为“RNA重塑因子”或“DEAD-box ATP酶”,而非传统的“DEAD-box解旋酶”。翻译起始需酵母中的Ded1(哺乳动物中为DDX3)和eIF4A1(Tif1/2或DDX2A/B),...
NCR | Ribo-seq应用:黄展鹏/林水宾揭示Mettl1通过翻译调控酮生成,推动心肌细胞成熟的代谢重编程
12-17
导读出生后,新生儿心肌细胞经历能量代谢和结构转变,从葡萄糖切换到脂质利用,以及胎儿型向成人型基因转换,逐步成熟。代谢重编程显著影响衰竭心脏。心力衰竭中,酮体作为能量来源备受关注,其氧化相关基因和代谢物增加,已有研究表明,增强酮体输送具有心脏保护作用。遗传突变干扰心肌细胞成熟常引发...
Mol Cell | 环状RNA触发无义介导的mRNA降解
12-13
导读环状RNA(circRNAs)在基因表达调控中发挥多种作用,包括影响转录、剪接、mRNA和蛋白质丰度。RNA-RNA相互作用可影响mRNA稳定性,例如,STAU1介导的mRNA降解(SMD)依赖于mRNA 3'UTR内或与长链非编码RNA形成的RNA双链。STAU1识别双链RNA并招募U...
综述 | 从顺式到反式:小开放阅读框(smORFs)功能在进化中出现
12-10
导读数十万个小于100个密码子的小开放阅读框(smORFs)广泛存在于每个基因组中,尤其是在长非编码RNA(lncRNA)和mRNA的5′非翻译区中。尽管smORFs通常被认为是无功能的,但Ribo-seq(核糖体印迹分析)表明,有数千个smORFs会被翻译。已被研究的smORF功能从个例逐渐展现出可识别...
综述 | 代谢与mRNA翻译:癌症可塑性的交汇点
12-06
导读肿瘤常因基因突变、缺氧以及恶劣的肿瘤微环境(TME)中的营养缺乏而面临能量匮乏,同时抗癌治疗也会加剧这种状况。这种代谢压力会触发mRNA翻译的适应性重编程,从而调整代谢可塑性及相关的信号通路,以维持肿瘤细胞的生存。新兴证据逐渐揭示了代谢与mRNA翻译之间复杂的相互作用,阐明了在...
CTM | Polysome profiling应用:PUS7依赖的ALKBH3 mRNA假尿苷化抑制胃癌进展
12-03
导读假尿苷化是常见的RNA修饰之一,参与多种细胞过程,能够增强碱基稳定性、改善碱基配对并稳定糖磷酸骨架,从而调控基因表达。该修饰的研究主要集中在tRNA、rRNA和snRNA中的假尿苷(Ψ)位点,其失调与肿瘤发生相关,虽然转录组技术揭示了Ψ在mRNA中的存在,但其生物功能仍不明确。假尿...
NC | Polysome profiling应用:姚红杰/张晓荣揭示核糖体生成的关键调控因子DDX10在胚胎干细胞中的重要作用
11-29
导读胚胎干细胞(ESCs)来源于胚泡内细胞团(ICM),具有快速增殖和多能性。ESC的命运由染色质、转录及转录后调控精密调节,其中核糖体生成通过促进rRNA转录和维持rDNA位点染色质完整性,支撑ESC自我更新。ESC的核糖体生成依赖小亚基(SSU)前体加工基因的高表达,以确保前体r...
Cell | 何川/潘滔通过转录组范围的snoRNA靶标识别,揭示snoRNA促进蛋白分泌的新机制
11-26
导读小核仁RNA(snoRNA)是天然的引导RNA,长度60–300个核苷酸,能通过核糖核蛋白复合物识别细胞RNA靶标。人类基因组中有超过1000个snoRNA基因,分为C/D-box、H/ACA-box snoRNA和小Cajal体特异性RNA(scaRNA)。A)snoRNA的主要功能是通过C/D-box和H/ACA-bo...
Genome Biology | 碱基编辑器在小鼠胚胎和人类初级T细胞中诱导脱靶结构变异
11-22
导读基因编辑的核心在于确保临床安全并避免基因毒性。多种方法已用于评估编辑工具的脱靶效应,并已开发了高保真CRISPR系统。除单核苷酸变异外,结构变异(如大缺失、易位)也成为临床关注重点。研究显示:A)CRISPR/Cas9可在小鼠及人类细胞中引发大缺失和染色体丢失,且相关染色体异常与...
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