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新使生物旨在为研究者提供强大的工具
NC | tRNA-seq应用:原核Schlafen蛋白在III型CRISPR免疫过程中切割tRNA
07-10
导读过去十年中,原核生物与真核生物的抗病毒免疫机制展现出惊人的相似性,揭示了两者之间深层的进化联系。这些保守的免疫策略包括由cGAS类酶产生的环状核苷酸信使以激活下游效应器,以及形成孔道复合物诱导细胞死亡。此外,模式识别受体和链终止核苷酸的产生也被证明是跨物种的防御手段。哺乳动物的...
Science | Ribo-seq应用:郑丙莲/张晓明团队揭示套索RNA降解对植物内源性siRNA稳态的调控机制
07-09
导读前体信使RNA(pre-mRNA)的剪接是真核生物基因表达的核心环节,它在产生mRNA的同时,会释放出一种名为“套索RNA”(lariat RNA)的环状内含子分子。在正常细胞中,这些套索RNA会被一种高度保守的去分支酶DBR1迅速解开并降解。DBR1功能的缺失会导致套索RNA在细胞内大量积...
tsRNA-seq技术服务 | 从tRNA到tsRNA,解锁小RNA研究新热点
07-08
01tsRNA介绍tRNA-derived small RNAs/fragments,简称tsRNA,也常被称为tdRs、tRF或tiRNA,是近年来RNA生物学和疾病机制研究中的重要新兴分子类型。越来越多研究表明,tsRNA不仅是tRNA降解片段,更可能参与基因表达调控、应激响应、发育调控、代谢稳态以及疾病发生发展过程...
Nature | Ribo-seq应用:N⁴-乙酰胞苷提高合成mRNA的翻译产量与保真度
07-07
导读合成mRNA疗法已成为治疗癌症和传染病等多种疾病的通用平台。为了实现细胞内递送,这些mRNA通常被封装在脂质纳米颗粒中,并整合修饰核糖核苷酸以提高稳定性、增强翻译效率并减轻免疫识别。N¹-甲基假尿苷(m¹Ψ)因其在促进翻译和降低免疫原性方面的有效性,已成为合成mRNA的行业标准。然...
PNAS | Ribo-seq应用:中国药科大学周君/刘晓敏团队揭示p53拮抗METTL5缺失诱导的肿瘤抑制机制
07-06
导读肺癌是全球范围内发病率和死亡率极高的恶性肿瘤,其中非小细胞肺癌约占总病例的85%。癌细胞通常表现出异常的mRNA翻译模式,以增强蛋白质合成并促进其在多变微环境中的存活与生长。细胞质蛋白质翻译与线粒体蛋白质翻译是细胞内两个独立且关键的合成过程,二者的失调均会导致严重的细胞功能障碍。...
iScience | Ribo-seq应用:李发金/杨雪瑞/Dieter A. Wolf团队揭示乳腺癌细胞对氨基酸饥饿的翻译抗性
07-05
导读翻译延伸是蛋白质合成中高度协调的过程,受多种细胞内外因素的精密调控。核糖体在mRNA上的移动速度并非恒定,而是受到密码子偏好性、mRNA二级结构及翻译延伸因子等内在因素的影响。此外,营养物质的可用性作为关键的外在因素,直接决定了细胞的生长与稳态。氨基酸剥夺是肿瘤微环境中常见的代...
Adv Sci | 江小华/刘洪彬/陈子江团队揭示eEF1G在精子发生早期的翻译调控机制
07-04
导读减数分裂是真核生物有性生殖的核心过程,通过同源染色体配对、联会及重组确保遗传多样性与基因组稳定性。在哺乳动物精子发生过程中,减数分裂前期I的细线期和偶线期是关键阶段,此时细胞需进行大规模的染色体重组与联会。然而,这一时期的精母细胞面临一个显著的生物学悖论,即在转录活性被全局性...
JCB | Ribo-seq应用:磷脂酰丝氨酸和RhoB连接PI4P与PA代谢以维持质膜特性
07-03
导读维持细胞器膜脂质成分的精确控制是保证细胞正常生理功能的基础。质膜内侧带负电荷的脂质如磷脂酰肌醇4-磷酸(PI4P)和磷脂酰丝氨酸(PS)等对招募和激活外周膜蛋白至关重要。质膜上的PI4P主要由磷脂酰肌醇4-激酶IIIα(PI4KIIIα)催化合成,是维持质膜身份的核心脂质分子。当细胞...
NBT | 利用先导编辑精准扰动uORF翻译,解锁丝状真菌的化学宝库
07-02
导读丝状真菌在自然生态系统中扮演着至关重要的角色,不仅驱动营养循环,还维持着植物与微生物的共生关系。这些真菌在工业、农业和生物医学领域具有广泛的应用价值,其基因组蕴含着巨大的生物合成潜力。然而,丝状真菌目前仍是遗传操作最困难的真核生物系统之一,其同源重组效率极低。传统的CRISP...
Nature | 哺乳动物中选择性RNA翻译解码产生稳定且高丰度的蛋白质
07-01
导读基因组中的遗传信息通过转录和翻译过程精确地传递给蛋白质,从而维持细胞的正常生理功能。在这一过程中,基因突变和RNA编辑等机制会引入氨基酸取代,进而显著改变蛋白质的稳定性和功能。此外,翻译过程中偏离标准遗传密码的“选择性翻译”(alternate translation)也是导致氨基酸取代的潜在途径...
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