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助力健康
发掘疾病靶点
新使生物旨在为研究者提供强大的工具
Nat Genet | Ribo-seq应用:前列腺癌的m6A图谱
03-28
导读癌症是一种基因组疾病,由体细胞突变驱动。癌症基因组受中心法则的细胞机制调控,导致转录组和蛋白质组的失调,并最终表现为临床症状。然而,癌症的蛋白质组和临床特征无法完全通过基因组和转录组解释,这表明存在广泛的转录后和翻译调控。RNA的化学修饰被认为是解释这些差异的重要因素之一。m6...
Sci Adv | Ribo-seq应用:tRNA乙酰化——调控哺乳动物应激反应的关键开关
03-25
导读tRNA在蛋白质合成中作为氨基酸与遗传密码的桥梁,具有超过100种RNA修饰。后生动物的tRNA平均含有约13种修饰,但这些修饰分布不均,有些普遍存在,有些则较为罕见。ac⁴C(RNA胞嘧啶乙酰化)是一种高度保守的修饰,广泛存在于所有生物域。ac⁴C由NAT10酶转录后修饰RNA,并通过适...
NAR | 核糖体停顿引发的小插曲:如何通过NIP5;1调控植物响应硼元素?
03-21
导读在真核生物中,基因表达涉及多个细胞区室。DNA在细胞核中转录后,mRNA前体经过加帽、剪接、3′ 端截短及poly(A) 添加,形成成熟mRNA,经核输出后在细胞质中翻译。mRNA稳定性受5′或3′ UTR调控,如5′ UTR上的uORF可通过核糖体停滞诱导mRNA降解,同时降低主ORF翻译效率...
Cell Rep | Polysome profiling应用:揭秘水稻光合作用的秘密——OsNAT10如何调控植物能量工厂
03-18
导读N4-乙酰胞嘧啶(ac4C)最早在细菌tRNA中被发现,并在真核生物tRNA和18S rRNA中参与核糖体生物发生。近期研究表明,ac4C是一种mRNA修饰,由NAT10(人类)和KRE33(酵母)催化,高温可诱导超嗜热古菌中ac4C积累,其缺失会引发生长缺陷。ac4C修饰存在于HIV-1 RNA上,N...
NAR | 揭秘eIF4F和eIF4B如何助力闭环结构完成翻译终止任务
03-14
导读eIF4F复合物(eIF4E、eIF4G、eIF4A)在帽依赖性翻译起始中至关重要。eIF4E识别5′帽结构,eIF4A作为RNA解旋酶,eIF4G作为支架蛋白,与eIF3结合促进48S PIC组装。eIF4A受eIF4B增强解旋活性,PABP通过eIF4G促进闭环结构形成,提高翻译效率。哺乳动物eIF...
NAR | 用CRISPR/Cas13X实现基因翻译调控,开启生物合成新时代!
03-11
导读合成生物学可构建微生物细胞工厂,将可再生原料转化为高价值化学品,对环境保护和循环经济具有重要意义。然而,微生物代谢网络复杂,资源优先用于细胞生长,影响目标产物产量。近年来,动态调控工具(如可诱导启动子、基因回路)被用于优化代谢流,但多局限于转录水平。事实上,相比转录,翻译调控...
NC | Ribo-seq应用:细胞压力下的生存法则——Grr1如何助力HAC1 mRNA剪切与翻译?
03-07
导读核糖体泛素化是翻译质量控制的关键修饰,涉及新生多肽(RQC)、mRNA(NGD)及非功能性rRNA(18S NRD)降解。在RQC中,酵母Hel2和哺乳动物ZNF598泛素化小亚基蛋白uS10,RQT复合物识别K63-连接的多聚泛素链,促进核糖体解离。哺乳动物的hRQT复合物执行相似功能,表明...
NC | Polysome profiling应用:解密植物应激反应——AP-3β如何帮助拟南芥清除热诱导的应激颗粒
03-04
导读植物在应激下会形成应激颗粒(SGs)来保护mRNA-核糖体复合物,解除应激后SGs解体,恢复翻译过程。因此,解析SGs解体机制对生长恢复至关重要。酵母和哺乳动物中,SGs清除由自噬、p97/Cdc48/VCP和26S蛋白酶体调控,不同应激诱导不同泛素化模式,K63-连接的泛素链促进SGs解体。植物...
Mol Ther Nucl Acids | AU富集元素如何促进蛋白质表达,提升mRNA翻译效率
02-28
导读COVID-19 mRNA疫苗的快速设计和开发标志着一种新型生物技术平台的出现,其具有应对SARS-CoV-2以及其他病原体和癌症的潜力。mRNA治疗的优势在于高效性、安全性和较低生产成本,关键在于优化mRNA序列以提升翻译效率,最大化治疗蛋白的表达。优化UTR(非翻译区)序列是提升mR...
Cell Rep | Polysome profiling应用:饥饿时,TIA1和Npl3如何协作启动细胞自我清理机制?
02-25
导读自噬是一个进化上保守的分解代谢过程,能通过降解细胞质中的物质来维持细胞稳态,清除损伤的细胞器和错误折叠的蛋白质,从而防止癌症、神经退行性疾病等病症的发生。自噬的过程需精细调控以避免不必要的细胞质分解。多种营养应答因子通过转录和翻译层面调控自噬基因的表达,调节自噬过程。Atg1/U...
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