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助力健康
发掘疾病靶点
新使生物旨在为研究者提供强大的工具
NC | Ribo-seq应用:破译新生肽链密码——靶向癌症翻译过程的新疗法
02-27
导读核糖体上的蛋白质合成是细菌和真核生物中许多天然产物抑制剂的靶点。在诸如癌症等快速分裂的细胞中,大多数核糖体都参与翻译延伸过程,因此该过程是翻译抑制剂的主要目标。然而,现有的人类翻译延伸抑制剂(如高三尖杉酯碱)因其无差别地抑制所有mRNA的翻译而存在潜在的毒性问题。为了降低这种毒...
核糖体隧道口的“守门人”——NAC复合物如何指引新生肽链的命运走向?
02-24
导读蛋白质的生物合成需要核糖体与多种共翻译因子的协同作用,这些因子共同决定了新生肽链的命运。这一过程必须精准完成,胞质和核蛋白需要立即进行N端成熟和折叠,而靶向内质网(ER)和线粒体的蛋白质则必须维持在未折叠状态以便于转运。为了协调这些看似矛盾的需求,一个高度选择性的分拣机制在核...
综述 | 钱书兵团队解读mRNA翻译过程中的核糖体动力学
02-20
导读翻译(Translation)是基因表达的中心环节,但远非一个匀速、流畅的过程。在翻译延伸阶段,核糖体沿着mRNA移动的速度是动态变化的,会经历减速(slowdown)、暂停(pause)、停滞(stall)乃至碰撞(collision)。生理性的暂停对于新生肽链的共翻译折叠至关重要,而异常的停滞和碰撞则会触发复...
Plant Commun | Polysome profiling应用:生长还是防御?拟南芥G蛋白AtYchF1的翻译抉择
02-17
导读生物体为了生长和生存,需要不断适应环境中各种生物和非生物胁迫。作为响应,生物体会重编程基因表达,进而改变细胞内各种蛋白质的丰度。例如,热激蛋白和活性氧清除剂等胁迫相关蛋白的表达通常会上调,以防止细胞损伤。细胞内蛋白质的丰度受到转录后调控、翻译控制和蛋白质降解等复杂过程的共同调...
Genome Biol | Ribo-seq应用:利用AI模型深度挖掘抗真菌小肽
02-11
导读植物抗真菌肽(AFPs)是植物先天免疫系统的重要组成部分,在防御真菌病原体中发挥核心作用。随着全球范围内植物病原真菌耐药性的日益增强,AFPs因其高效且环境友好的特性,成为开发新型植物保护策略的理想替代方案。除了传统的分泌型防御素等肽类,近年通过核糖体印迹分析(Ribo-seq)等技术...
aBIOTECH | 蛋白质翻译重编程:平衡植物抗病与生长的新支点
02-10
导读植物免疫机制的探索为作物抗病工程提供了新的途径。然而,通过异位表达抗性基因等方法获得的抗病性往往伴随着生长适应性代价,这使得改良后的种质在农业应用中并不理想。因此,诱导型抗性因子的生产被认为是解决这一问题的潜在方案。真核生物中,mRNA的翻译主要以帽依赖的方式进行,43S前起始复...
Adv Sci | Ribo-seq应用:多组织组学分析揭示猪复杂性状的翻译调控机制
02-06
导读基因的转录和翻译变异在塑造复杂性状和疾病表型中起着关键作用。尽管蛋白质水平受转录、剪接、mRNA降解、翻译及翻译后修饰等多级调控,但现有研究多集中于RNA丰度的控制机制。在多物种中,群体规模的表达定量性状位点(eQTL)研究已系统识别了影响mRNA丰度的遗传变异,极大地促进了对遗...
NAR | Polysome profiling应用:病毒与植物围绕m⁶A修饰的攻防博弈
01-30
导读N⁶-甲基腺嘌呤(m⁶A)是真核生物信使RNA(mRNA)上最常见的表观转录组修饰,在调控RNA代谢和生理过程中发挥着关键作用。m⁶A修饰由甲基转移酶(writers)、去甲基化酶(erasers)和m⁶A结合蛋白(readers)动态调控,其中一个重要功能是介导RNA的降解。近年研究发现,m⁶A修饰也...
Mol Cell | Polysome profiling应用:东南大学高山团队揭示ICAM1 mRNA的肿瘤抑制新功能
01-27
导读分子生物学的中心法则阐述了遗传信息从DNA流向mRNA再到蛋白质的过程,明确了mRNA作为蛋白质合成模板的核心地位。然而,非编码RNA的发现极大地丰富和挑战了我们对基因表达调控的传统认知。尽管如此,我们对RNA分类和功能的理解仍存在显著空白。近年来研究发现,一些传统上被认为是编...
Nature | Ribo-seq应用:组织驻留巨噬细胞的分化依赖DHPS介导的翻译调控
01-23
导读组织驻留巨噬细胞(RTMs)是维持组织健康和稳态的核心细胞,它们在胚胎期就进入组织并通过自我更新长期存在。RTMs在不同组织中执行特异性功能,例如在脑部修剪神经元突触,在肺部清除表面活性物质,在肝脏清除衰老的红细胞。当组织受损时,骨髓来源的单核细胞会进入组织并分化为RTMs,以修...
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