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助力健康
发掘疾病靶点
新使生物旨在为研究者提供强大的工具
Mol cell | Ribo-seq应用:张汕/王勇团队发现遗传密码的内在偏好性塑造微蛋白的折叠与稳定性
05-21
导读传统的蛋白质编码基因注释依赖于序列保守性、AUG起始密码子和长度大于100个密码子等标准。然而,核糖体印迹分析(Ribo-seq)技术的进步揭示了基因组中存在大量非经典翻译事件,它们主要发生在信使RNA的非翻译区(UTR)或非编码RNA上。这些翻译事件产生了成千上万种通常被称为微蛋白的...
Nature | Polysome profiling应用:SNOR促进细胞休眠后的翻译重启
05-20
导读营养剥夺会触发细胞的代谢应激通路并启动适应性程序以维持细胞存活。在长期应激下,细胞可进入一种可逆的非增殖休眠状态,其特征是代谢活性低下,从而在长期缺乏营养或水分的情况下存活。这种休眠现象广泛存在于真菌、原生动物、植物、动物甚至癌细胞等多种真核系统中。在指数生长期,酵母将高达50...
Nat Microbiol | tRNA-seq应用:阿米巴巨型病毒构建特化亚细胞环境以实现高效翻译
05-19
导读真核生物病毒的密码子使用偏好性往往与其宿主存在显著差异,这种不匹配可能对病毒基因的高效翻译构成挑战。在快速生长的微生物中,偏好使用的密码子通常与高拷贝数的tRNA相对应,以确保蛋白质合成的效率。巨型病毒以其庞大的基因组、复杂的代谢重编程能力及巨大的病毒粒子为特征,在感染过程中会...
Oncogene | Polysome-seq应用:PIWIL1激活R2TP-mTORC1轴促进胃癌TOP mRNA翻译
05-18
导读胃癌是全球第五大癌症相关发病和死亡原因,其发病率在东亚地区最高。尽管手术、化疗及部分靶向治疗改善了患者预后,但现有靶点常在正常组织中表达,引发了脱靶毒性的担忧。PIWI蛋白家族通常在生殖系中发挥关键作用,它们与piRNA结合形成复合物以调控基因表达。然而,PIWI蛋白在包括胃癌...
NC | Poly(A)尾测序应用:NMD途径通过识别短poly(A)尾调控非经典靶标mRNA的降解
05-17
导读无义介导的mRNA降解(NMD)是一条在真核生物中高度保守的重要细胞质质控途径。它通过清除含有提前终止密码子(PTC)的异常转录本来防止产生具有潜在危害的截短蛋白。Upf1是该途径的核心因子,也是一种依赖于ATP的RNA解旋酶。在酵母中,Upf1-23复合物与翻译释放因子相互作用以促进...
PLOS Biol. | Ribo-seq应用:生命不可承受之“重”,多余的染色体为何导致细胞未老先衰?
05-16
导读染色体数目异常(非整倍体)是哺乳动物发育过程中的严重障碍,也是导致人类不孕不育的主要原因之一。唐氏综合征是由21号染色体三体引起的,它是唯一能存活至成年的人类常染色体非整倍体疾病。尽管医疗水平不断进步,但唐氏综合征患者仍面临严重的早衰问题,包括组织退化、神经退行性病变及寿命缩短...
Nature Plants | Ribo-seq应用:张秀任/何川团队揭示CDS-m⁶A 驱动共翻译RNA降解以缓解内质网应激
05-15
导读内质网是真核生物蛋白质合成、折叠及质量控制的核心场所,对于维持细胞内稳态至关重要。当环境发生波动时,内质网极易受到干扰,进而引发内质网应激。为了应对这种压力,真核生物进化出了未折叠蛋白反应(UPR)和内质网相关降解(ERAD)途径,通过上调分子伴侣和清除错误折叠蛋白来恢复平衡...
BMC Biol. | Ribo-seq应用:陈明明团队揭示eIF2B介导海稻HD961耐盐性的翻译调控机制
05-14
导读水稻作为全球过半人口的主食,其稳定生产对于保障粮食安全和经济稳定具有至关重要的作用。然而全球约有20%的灌溉农田受到土壤盐渍化的威胁,这一数字还因海平面上升和气候变化等因素不断攀升。土壤高盐环境会引发水稻渗透应激和离子毒性并严重影响其关键生长阶段,最终导致产量大幅下降。尽管传统育...
Cell Stem Cell | Ribo-seq应用:山中伸弥团队揭示eIF4G2介导的翻译调控维持成体肠道干细胞特性
05-13
导读蛋白质翻译起始过程在发育、应激反应和组织再生等生命活动中会发生重塑,并通过选择性地改变蛋白质产出来快速重塑细胞状态。eIF4G2是一种非经典的eIF4G家族翻译起始因子。此前的研究暗示eIF4G2参与了对特定mRNA的选择性翻译,这些mRNA通常具有结构化的5’非翻译区(5'UTR)或...
Zool Res | Ribo-seq应用:王治娟/张美佳揭示雄性生殖细胞特异性缺失Eif5引发精原祖细胞凋亡机制
05-12
导读精子发生是一个高度协调且受严格调控的发育程序,持续于雄性的整个生命周期。在这一过程中,精原干细胞通过有丝分裂实现自我更新或分化为祖精原细胞,进而发育为精母细胞。蛋白质翻译的精准时空调控对精原细胞的增殖、分化及减数分裂的顺利完成至关重要。真核翻译起始过程由一系列因子(eIFs)协...
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