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助力健康
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新使生物旨在为研究者提供强大的工具
NCB | m⁶A测序应用:刘建钊/冯新华/周芳芳/张龙团队合作揭示细胞周期驱动的METTL14非经典泛素化调控RNA甲基化
10-08
导读N⁶-甲基腺苷(m⁶A)是真核生物mRNA中最普遍的内部修饰,在转录后基因调控中发挥核心作用。m⁶A修饰由甲基转移酶复合物(m⁶A-MTC)共转录执行,其中METTL3-METTL14异二聚体是催化核心。尽管m⁶A在多种生理和病理过程中具有重要调节作用,但其酶活性如何随细胞周期动态变化以...
Sci Adv丨Polysome profiling应用:复旦大学严冬揭示NAT10通过维持核糖体稳态与抑制Xrp1应激通路调控发育
10-06
导读近年来RNA修饰已成为调控基因表达的重要表观转录组机制,并在各类生物RNA中广泛存在。作为真核生物RNA中目前已知唯一的乙酰化修饰,N⁴-乙酰胞苷(ac⁴C)主要由保守的N-乙酰转移酶10(NAT10)催化生成。在酵母和哺乳动物中,NAT10不仅催化转运RNA(tRNA)和核糖体RNA(...
Commun Biol丨Polysome profiling应用:核糖体翻译的意外刹车——人源无细胞筛选锁定真菌毒素NT-2
10-05
导读蛋白质合成与翻译调控在生命活动和疾病发生中发挥着核心作用。翻译抑制剂是探测核糖体功能及开展疾病治疗的重要工具。传统基于活细胞的筛选方法常受限于化合物摄取、细胞毒性及复杂的生理环境。常规的无细胞系统则缺乏人类特异性背景且难以满足高通量筛选(HTS)的需求。真菌代谢产生的霉菌素作...
Plant Cell | Ribo-seq应用:隐秘微肽的生命密码——水稻lncRNA翻译潜力的多组学探秘
10-04
导读真核生物基因组会转录大量非编码RNA(ncRNA),它们曾被长期认为不具备翻译成蛋白质的潜力。其中,长链非编码RNA(lncRNA)是指长度大于200个核苷酸且缺乏保守蛋白质编码能力的转录本,但在多种细胞过程中发挥着重要的调控功能。已有研究表明,植物lncRNA参与调控发育、开花和胁迫响...
NC | Poly(A)尾测序应用:mRNA poly(A)尾长度调控决定哺乳动物胚胎体轴发育
10-03
导读在早期胚胎发育过程中,原肠胚形成是多能外胚层分化为外胚层、中胚层和内胚层三个胚层的核心事件。这一过程高度依赖于内源性基因调控程序与空间位置信号的精密整合,从而建立机体的多维体轴蓝图。过去的研究主要利用先进成像和高通量测序技术揭示了转录层面对早期发育和体轴建立的调控机制。然而,...
EMBO J | m⁶A测序应用:单核苷酸m⁶A图谱揭示YTHDF蛋白在涡虫祖细胞命运决定中的功能冗余性
10-02
导读细胞命运的决定需要基因表达的精确调控。作为转录后修饰的一种,N⁶-甲基腺苷(m⁶A)在多种生物过程中扮演着关键的调控角色。m⁶A是转录组中最普遍的mRNA修饰,其功能由一系列写入蛋白(甲基转移酶复合体)、擦除蛋白和读取蛋白(如YTHDF家族)共同介导。在具有强大再生能力的涡虫中,...
Cell Rep丨Ribo-seq应用:ARHGEF17-AS1 RNA与其翻译产物“兵分两路”共护有丝分裂纺锤体
10-01
导读传统基因组学曾将基因组位点严格划分为蛋白质编码区与非编码区。然而,核糖体印迹分析(Ribo-seq)和质谱技术快速发展表明,转录组中的翻译活动远比想象中普遍,许多曾注释为长链非编码RNA(lncRNA)的转录本,实际隐藏着可被翻译的开放阅读框(ORF)。这类兼具非编码调控功能与蛋白质翻...
EMBO Rep丨Ribo-seq应用:王璐团队揭示tRNA m¹A修饰翻译调控造血干祖细胞发育新机制
09-30
导读造血干祖细胞(HSPCs)通过精细平衡的自我更新、分化与休眠来维持脊椎动物终生的血液细胞供应。在脊椎动物胚胎发育过程中,最早的HSPCs由主动脉-性腺-中肾(AGM)区域的主动脉腹侧壁生血内皮细胞(HECs)经内皮-造血转化(EHT)产生。EHT发育过程伴随着显著活跃的核糖体生物发...
NAR丨Ribo-seq应用:2'-O-甲基化介导的RNA翻译起始调控新机制
09-30
导读真核生物的翻译起始是一个复杂的分子间相互作用过程,需要高效识别最佳的AUG起始密码子。然而翻译起始复合物经常在上游非最佳起始密码子或近同源密码子处起始,从而导致上游开放阅读框的表达。这些上游开放阅读框过去被认为仅是顺式调控序列,但近期研究表明它们还能产生具有多种生物学功能的稳...
Sci Adv丨Polysome profiling应用:TANGO6介导的核质RNA穿梭与翻译调控网络
09-29
导读分化细胞需要精确调控自身蛋白质组以维持正常的细胞生理机能与特化功能。当面临内外环境应激造成的生物大分子损伤时,细胞必须迅速重编程核糖核酸(RNA)与蛋白质合成以维持蛋白质稳态。在转录水平上,RNA聚合酶II(Pol II)驱动前体信使RNA(mRNA)的生成,其在启动子近端的暂停...
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