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发掘疾病靶点
新使生物旨在为研究者提供强大的工具
JIPB丨Poly(A)尾应用:水稻耐盐性的3' UTR重塑与翻译调控机制
10-19
导读精准调控成熟信使RNA(mRNA)的生物发生对生物体生存至关重要。其中多聚腺苷酸化是一个关键的酶促反应过程可确保mRNA稳定性和核输出。选择性多聚腺苷酸化(APA)通过选择性利用多个多聚腺苷酸位点发生在约70%的真核基因中。这种机制在保持蛋白质编码序列相同的同时产生了具有可变3'...
Mol Cancer丨Polysome profiling应用:IGF2BP3劫持RNA翻译链条,驱动食管鳞癌免疫逃逸
10-16
导读食管鳞状细胞癌(ESCC)是一种高度侵袭性的恶性肿瘤,其预后极差,五年生存率不足20%。该肿瘤的进展与治疗抵抗在很大程度上归因于其复杂的肿瘤微环境(TME),其中免疫抑制性微环境起到了关键作用。肿瘤微环境由癌细胞、基质成分、免疫浸润细胞及趋化因子等组成,其分子配置决定了肿瘤的生长...
EMBO Rep丨m⁶A测序应用:膀胱癌m⁶A密码——全局甲基化水平稀释与局灶性3' UTR高甲基化
10-16
导读N⁶-甲基腺苷(m⁶A)是真核生物信使RNA(mRNA)中最常见且丰度最高的内部修饰,在RNA的整个生命周期中发挥关键调控作用。该修饰由METTL3–VIRMA甲基转移酶复合体催化沉积,并经阅读蛋白调控转录本剪接、转运、稳定性及翻译。已有大量研究表明m⁶A修饰系统的失衡与人类恶性肿...
Mol Cell丨m⁶A测序应用:北大伊成器揭示PARP1催化写入蛋白修饰介导的RNA m⁶A稳态反馈机制
10-15
导读N⁶-甲基腺苷(m⁶A)是真核生物mRNA中最丰富的内部化学修饰之一,能够影响RNA剪接、稳定性、定位和翻译等多个环节。m⁶A主要由METTL3、METTL14和WTAP组成的写入复合体安装,由FTO和ALKBH5等去甲基化酶擦除,并由YTH家族蛋白和IGF2BPs等阅读蛋白识别。不同...
NCB丨tRNA-seq应用:饥饿肿瘤如何利用RNA修饰操纵核糖体错误翻译
10-14
导读色氨酸是一种必需氨基酸,在肿瘤微环境中活化T细胞分泌的干扰素γ(IFNγ)作用下,癌细胞内的色氨酸会被耗竭。IFNγ会诱导吲哚胺2,3-双加氧酶1(IDO1)的转录激活,该酶能将色氨酸降解为犬尿氨酸。此外,在色氨酸缺乏时,色氨酰-tRNA合成酶(WARS1)可将苯丙氨酸错误装载到色氨酸...
Nature丨Polysome profiling应用:tRNA丰度决定前列腺癌谱系依赖性与耐药性
10-13
导读肿瘤细胞的谱系可塑性是指细胞能够转变为具有不同表观遗传状态、转录程序和形态特征的替代性细胞身份。在癌症中,治疗压力可能诱导肿瘤细胞摆脱原有的谱系依赖,从而产生适应性耐药和疾病进展。前列腺癌通常依赖雄激素受体(AR)维持生长,因此AR信号通路是其重要治疗靶点。第二代雄激素受体通...
BMC Genomics丨Poly(A)尾应用:张勇团队揭示Nudt21缺失使小鼠肝细胞RNA的3' UTR变短并改写转录命运
10-11
导读真核生物的基因表达受到转录、RNA加工、稳定性和翻译等多层级调控,转录后调控是决定成熟信使RNA命运和蛋白质产出的关键环节。替代性多聚腺苷化(APA)可通过选择不同的多聚腺苷化位点,生成具有不同3' UTR长度的转录本。3' UTR包含微小RNA(miRNA)结合位点、RNA...
Cell Rep丨m⁶A测序应用:邓新团队绘制跨细菌物种单碱基m⁶A高精度全景图谱
10-10
导读N⁶-甲基腺苷(m⁶A)是真核生物中最普遍的RNA修饰,由甲基转移酶复合物催化,富集于终止密码子附近及3' UTR。其修饰状态由去甲基化酶和结合蛋白精细调控,在mRNA稳定性、剪接、核输出和翻译效率等代谢过程中起核心作用。相比之下,原核生物细菌中的RNA修饰研究起步较晚,其mRN...
Sci Adv丨tRNA应用:让翻译RNA精准纠正无义突变,治疗杜氏肌营养不良症
10-10
导读杜氏肌营养不良症(DMD)是一种主要影响男孩的致命性X染色体连锁隐性遗传病,全球患病率约为每5000名男孩1例。其根本原因是DMD基因发生功能丧失性突变,导致抗肌萎缩蛋白(dystrophin)缺失,使肌细胞膜在收缩过程中失去稳定性。患者通常出现进行性骨骼肌无力、运动能力下降、呼吸肌损害及心...
NAR丨tRNA应用:锁定翻译关键RNA的ADP核糖基化毒素阻断ACC密码子解码
10-09
导读细菌在密集且营养受限的环境中生存,通常会利用特化的分泌系统向竞争对手递送抗菌毒素以争夺生态位。其中VI型分泌系统(T6SS)是一种广泛存在于革兰氏阴性菌中的收缩型分子注射机器,通过发射由穿刺蛋白复合体构成的管状结构递送效应蛋白进入靶细胞。重排热点(Rhs)蛋白是一类重要的T6SS...
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