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新使生物旨在为研究者提供强大的工具
PNAS丨tRNA-seq应用:拟南芥tRNA尿苷硫修饰缺失影响mRNA翻译、蛋白质生成与代谢物积累
10-27
导读生物体必须感知环境中的营养状况并相应地调节代谢输出以维持生存。将营养状态与蛋白质翻译过程相偶联是实现这一调节的关键机制之一。mRNA的转录后修饰(即表观转录组学修饰)已被证实能影响mRNA的成熟、稳定性、输出及翻译潜力。tRNA的表观转录组学修饰最初被认为是静态的化学修饰,但近期...
NCB丨Ribo-seq应用:序列特异性小分子对核糖体翻译的靶向调节机制
10-26
导读蛋白质合成是生命活动的基础,细胞依赖复杂的翻译机器将信使核糖核酸(mRNA)模板转化为精确的氨基酸序列。长期以来,小分子抑制剂被广泛用作探针,以剖析蛋白质生物合成的机制,而无需对翻译机器的组成部分进行遗传操作。随着高通量测序技术和结构生物学方法的进步,科学家对翻译过程的机制理解...
iScience丨Polysome profiling应用:LncRNA Arsa-DT通过控制G2/M进程保障雄性生殖细胞发育
10-25
导读男性不育症是全球重大的生殖健康负担,影响着全球约15%面临生育困难的夫妇。在所有不育症病例中,由男性因素导致的比例高达30%至50%。精子发生过程中的细胞异常分裂或生精功能障碍是引发男性不育的主要病理生理学因素。睾丸生殖细胞通过连续进行严格调控的有丝分裂与减数分裂来确保精子的持续产生,...
Nature丨Polysome profiling应用:神经元持续应激信号通过抑制翻译导致Angelman综合征表型
10-24
导读Angelman综合征(AS)是一种严重神经发育障碍,典型表现包括智力障碍、发育迟缓、癫痫、小头畸形、特殊面容和特征性行为。AS主要由母源UBE3A缺失或突变引起,UBE3A编码同源于E6-AP羧基端(HECT)家族的E3泛素连接酶。在神经元中UBE3A呈印记表达,通常只有母源等位基因表达...
Cell Rep丨Polysome profiling应用:基于5' UTR重排的核糖体翻译调控新机制
10-23
导读癌症中的基因融合通常被认为是产生具有杂合功能变异的蛋白从而促进肿瘤的发生与发展。这些嵌合蛋白往往结合了供体基因的调节和催化结构域,从而导致信号通路的持续激活或正常细胞调控机制的丧失。临床上比较典型的致癌事件包括慢性髓系白血病中的BCR-ABL融合以及非小细胞肺癌中常见的ALK和...
Virulence丨Polysome profiling应用:徐胜奎团队发现赤羽病毒通过解聚应激颗粒与加工小体促进病毒转录与复制
10-22
导读布尼亚病毒目(Bunyaviricetes)是RNA病毒中最大的类群,包含多种严重威胁人类、动物及植物健康的病原体。赤羽病毒(AKAV)作为正布尼亚病毒属(Orthobunyavirus)的成员,主要引起牛羊等反刍动物的生殖障碍。该病毒基因组由三个片段的负链单链RNA组成,并在宿主细胞内通过帽依赖性核酸...
NAR丨Ribo-seq应用:铜绿假单胞菌中MiaA依赖的tRNA修饰网络连接翻译调控与致病表型
10-22
导读转运RNA(tRNA)是翻译机制的重要组成部分,负责在蛋白质合成过程中将信使RNA(mRNA)密码子解码为氨基酸。除了这一典型功能外,tRNA还经历了大量转录后修饰,以确保翻译的准确性、效率和细胞适应性。特别是位于第34位和第37位的修饰至关重要,前者影响密码子配对,后者稳定密码子-...
Nat Commun丨Poly(A)尾测序应用:范衡宇团队揭示PAN2在小鼠精子形成中维持mRNA尾长稳态并调控蛋白质翻译
10-21
导读真核细胞中mRNA的3’端多聚腺苷酸(poly(A))尾的长度动态变化是基因表达调控的核心环节。mRNA的降解通常起始于poly(A)尾的缩短,这一过程主要由胞质中的多聚腺苷酸特异性核糖核酸酶(PAN2-PAN3)复合体与CCR4-NOT复合体协同完成。在哺乳动物中,poly(A)尾的稳态长度维持在80...
Genome Biol丨poly(A)测序应用:翟继先/张雨解析植物mRNA尾巴的进化密码
10-21
导读真核mRNA的3’端多聚腺苷酸化是一种高度保守且必需的转录后修饰,影响翻译、RNA稳定性与定位。poly(A)尾长度由加尾和去腺苷化动态平衡决定,核内poly(A)聚合酶(PAP,植物中为PAPS)合成尾巴并由核poly(A)结合蛋白(PABPN)结合。mRNA出核后PABPN逐渐被胞质poly(A)结...
CDD丨Polysome profiling应用:PABPC1通过mRNA翻译调控ATF4–BCAT1轴,驱动前列腺癌去势抵抗
10-20
导读前列腺癌(PCa)是全球男性中第二大高发恶性肿瘤以及第五大癌症致死原因。雄激素剥夺治疗(ADT)是晚期前列腺癌的标准基石疗法,在治疗初始阶段通常能诱导显著的肿瘤缓解。然而,几乎所有患者最终都会不可避免地进展为高致死性的去势抵抗性前列腺癌(CRPC),面临极差的临床预后与极为匮乏...
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