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Science | Ribo-seq应用:用CRISPR打开核糖体RNA开关操控翻译和干细胞命运
09-15
导读蛋白质翻译速率在不同细胞类型之间存在显著差异,但这些差异如何受到调控及其对细胞行为的重要性仍不清楚。既往研究主要关注哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)等生长信号通路,以及翻译起始因子、RNA结合蛋白和非编码RNA对特定信使RNA(mRNA)翻译的调控。相比之下,作为蛋白质合成核...
Curr Biol丨“断”处逢生——章鱼核糖体核心区的演化巧思
09-14
导读章鱼展现出与复杂脊椎动物相媲美的高级复杂行为和庞大神经系统。然而与其它无脊椎动物相比其基因组并没有表现出巨大的新颖性因此这种复杂适应性是如何在进化过程中产生的仍是一个未解之谜。蛋白质组多样性的转录后调节一直被认为是促进头足类动物神经系统复杂化的重要机制。核糖体(ribosome)作为...
Vita丨m⁶A测序应用:复旦大学叶丹/陈磊蕾/蓝斐/熊跃合作揭示衣康酸调控RNA m⁶A修饰以沉默内源性逆转录病毒
09-12
导读内源性逆转录病毒(ERVs)是古代逆转录病毒整合并遗留在宿主基因组中的序列残留,约占人类基因组的8%。在生理稳态下,ERVs通过组蛋白修饰、DNA甲基化和RNA甲基化等多层表观遗传机制被严格沉默。巨噬细胞作为固有免疫应答的前线效应细胞,在遭遇炎症、病原体感染或细胞应激时极易发生染...
Sci Bull丨Poly(A)尾测序应用:范衡宇/陆发隆/嵇姝妍揭示母源PAN2通过维持poly(A)尾稳态驱动卵母细胞-早期胚胎转换
09-11
导读真核生物中mRNA降解受到去腺苷酸化的限速调控,PAN2-PAN3复合物先缩短poly(A)尾,随后CCR4-NOT复合物完成近端去腺苷酸化。PAN2是催化亚基,PAN3作为支架通过PABP将PAN2招募至mRNA。卵母细胞生长过程中会预先合成并储存大量母源mRNA和蛋白,转录在细胞生长到合适...
Cell Rep丨Ribo-seq应用:EBV编码的snoRNA通过rRNA甲基化调控翻译与病毒裂解
09-11
导读EBV是一种普遍存在的人类γ-疱疹病毒,全球超过90%的成年人被感染。该病毒与多种恶性肿瘤(如伯基特淋巴瘤、霍奇金淋巴瘤)和自身免疫性疾病的发生密切相关。EBV主要感染B淋巴细胞和上皮细胞,并在其中建立终身潜伏感染。在潜伏期,病毒基因组以核内附加体的形式存在,表达一组有限的病毒产...
NAR丨Ribo-seq应用:康奈尔大学钱书兵团队揭示蛋白质合成中肽键跳跃的分子机制
09-10
导读病毒2A寡肽能够驱动一种非同寻常的核糖体重新编码事件。在此过程中肽键形成在保守的PGP基序处发生停滞并产生两种离散的蛋白质,而无需经历经典的翻译终止。在基因治疗、基因组工程以及重组蛋白生产领域,由于其稳健性和模块化特征,2A肽被广泛用于实现单开放阅读框内多蛋白的等化学计量表达。...
NAR | tRNA应用:TRMT11–TRMT112复合物调控线粒体tRNA的m²G10修饰
09-09
导读修饰核苷酸是细胞RNA功能的重要特征,它们能够精细调控并动态调节基因表达。通过增加标准核苷的化学多样性,RNA修饰能够调节RNA与RNA或RNA与蛋白质的相互作用,从而影响RNA的结构、稳定性和功能。在所有转录本中,转运RNA(tRNA)是修饰最广泛且最多样化的RNA类型,这些...
综述 | 神经系统中的翻译延伸调控机制
09-07
导读蛋白质合成是神经元发育、可塑性及稳态维持的核心能量依赖过程。长期以来,翻译调控的研究重心多集中在起始(Initiation)阶段。然而,随着对翻译延伸(Elongation)作为关键调控节点的认识加深,研究发现延伸因子(eEFs)、核糖体速度及tRNA动态在神经元高度极化的空间结构中发挥着不可替代...
亮点 | 针对罕见病治疗的翻译重编程策略:大基因面临的瓶颈与突破
09-06
导读基因治疗在遗传性疾病领域取得了里程碑式的进展,特别是针对OTOF基因突变导致的遗传性耳聋,双腺相关病毒(AAV)介导的基因替代疗法已展现出显著的临床疗效。然而,大基因的递送限制、载体容量瓶颈以及复杂疾病的遗传异质性,仍是当前精准医疗面临的主要挑战。2026年8月26日,匹兹堡大学Jo...
Nature | Polysome profiling应用:核糖体的“自产自销”——翻译写在自己基因里的蛋白质
09-05
导读细胞内的蛋白质合成依赖于核糖体与mRNA之间的随机碰撞,这种机制限制了翻译机器在生产单一蛋白质时的优化效率。在合成生物学领域,为了生产含有非天然氨基酸或特殊序列的定制蛋白质,往往需要对核糖体进行改造。然而,为新功能改造核糖体通常会削弱其翻译细胞内正常蛋白质组的能力,从而导致细胞...
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