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助力健康
发掘疾病靶点
新使生物旨在为研究者提供强大的工具
NCB | Polysome profiling应用:非典型E3连接酶HOIL-1在细胞应激期间保护核糖体稳态
05-11
导读核糖体已成为一个重要的信号中心,能够感知代谢紊乱并协调细胞响应,以恢复体内平衡或启动细胞死亡。然而,通过核糖体发出信号的损伤范围以及控制细胞命运决定的机制仍未完全阐明。许多此类威胁最终都会汇聚到整合应激反应(ISR)上,在此过程中,整体蛋白质翻译被抑制,而转录因子ATF4则被选...
Science | tRNA-seq应用:人类DHX29通过检测非最优密码子使用调控mRNA稳定性
05-10
导读遗传密码具有简并性,多个同义密码子编码同一种氨基酸,但它们在功能上并不等同。同义密码子的使用会显著影响mRNA的稳定性和翻译效率,这种现象在不同物种中普遍存在。富含最优密码子的mRNA通常表现出较高的稳定性和翻译效率,而富含非最优密码子的mRNA则会被快速降解。翻译与mRNA降解...
Nature | Ribo-seq应用:挖掘生命“暗物质”,微蛋白和Peptideins开启蛋白质组学新大陆
05-09
导读表征蛋白质编码基因组是研究人类健康的基础,也是一项重大的科学目标。蛋白质编码基因是生物医学研究的基石,绝大多数药物开发项目都以此为基础。然而,人类基因组是否编码了远超约19500个经典蛋白质编码基因一直存在激烈争论。近十年来,科学家们在多种人类细胞类型和疾病状态下观察到非经典开放阅...
Adv Sci | Ribo-seq应用:THUMPD1通过IGF2R依赖性铜死亡抑制肺腺癌进展
05-08
导读肺腺癌(LUAD)是全球癌症相关死亡的主要原因之一,其预后与诊断时的临床分期密切相关,晚期患者的生存率极低。尽管靶向治疗和免疫治疗取得了一定进展,但晚期或转移性肺腺癌的治疗效果仍不理想,因此亟需寻找新的预后生物标志物并阐明其发病机制。N4-乙酰胞苷(ac⁴C)是一种重要的RNA修...
NCB | Ribo-seq应用:王芳/钱鹏旭/余佳团队揭示NAT10通过非催化功能维持造血干细胞稳态
05-06
导读造血干细胞(HSC)是研究干细胞维持的经典体系,它在整个生命周期中持续补充循环血细胞。HSC的自我更新与分化平衡对维持造血稳态至关重要,这一过程由一个精确调控的基因表达程序所控制。已有研究揭示了HSC必需基因的表达程序受到表观遗传修饰、转录因子和蛋白质降解等多种机制的调控。在...
综述 | 血红素调节激酶HRI——连接翻译调控与人类疾病的分子节点
05-05
导读血红素调节抑制剂(HRI)曾被长期认为仅限于调节红细胞中血红素与珠蛋白的合成平衡。然而,随着研究的深入,这一经典的eIF2α激酶已被重新定义为一个多维度的细胞稳态传感器。它不仅在应对线粒体应激、细胞质蛋白折叠压力中发挥核心作用,还深度参与了先天免疫、神经生物学稳态及肿瘤抑制过程...
Sci Adv | Poly(A)尾测序应用:调控MASLD进展的转录后重编程机制
05-04
导读代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)已成为全球范围内极其普遍的慢性肝病,影响着近20亿人的健康。该疾病包含从单纯性肝脂肪变性(SLD)到严重的代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)的连续演变过程。长期高脂肪饮食摄入诱导的代谢压力是推动MASLD发生及其向肝硬化和肝细胞癌进展...
NAR | Ribo-seq应用:计算预测辅助蛋白质组学揭示植物中广泛的非AUG翻译起始事件
05-03
导读蛋白质翻译是遗传信息表达的关键环节,精细调控着生物体内蛋白质合成的种类与水平。在传统的真核生物翻译模型中,核糖体通常识别编码序列起始端的AUG密码子来启动翻译过程。然而,近年来的研究打破了这一固有认知,揭示了多种非规范翻译事件在生物界中的普遍存在。其中非AUG翻译起始作为一种...
Nature | Polysome profiling应用:抗CRISPR蛋白介导的cas12 mRNA翻译依赖性降解
05-02
导读细菌进化出多种防御系统,包括CRISPR-Cas系统,以识别并切割噬菌体及其他移动遗传元件的DNA。作为反制措施,噬菌体编码抗CRISPR(Acr)蛋白,通过阻断DNA结合或切割来抑制CRISPR-Cas活性。大多数已知的Acr蛋白通过直接结合核糖核蛋白复合物来抑制其功能,或者通过酶促...
Sci Adv | Ribo-seq应用:AMD1 C-末端尾部停滞肽介导的核糖体停滞机制
05-01
导读细胞通过调节蛋白质合成的各个步骤来响应环境变化和代谢需求,以确保生存。核糖体能够主动感知mRNA通道或多肽出口通道中的序列元件,从而控制基因表达。多胺是调节细胞生长和增殖所必需的阳离子分子,其代谢酶的翻译受到严格调控。AMD1作为多胺生物合成的关键酶,其翻译效率受到多种机制的精...
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